RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.23■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.23■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.22■■■□□ 2.11
UBE2E3-201ENST00000392415 NBPF14Q5TI25 921 aa28.19■■■□□ 2.1
UBE2E3-201ENST00000392415 PROM2Q8N271 834 aa28.19■■■□□ 2.1
UBE2E3-201ENST00000392415 NCAPD2Q15021 1401 aa28.19■■■□□ 2.1
UBE2E3-201ENST00000392415 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
UBE2E3-201ENST00000392415 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
UBE2E3-201ENST00000392415 MORC1Q86VD1 984 aa28.18■■■□□ 2.1
UBE2E3-201ENST00000392415 BTAF1O14981 1849 aa28.16■■■□□ 2.1
UBE2E3-201ENST00000392415 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
UBE2E3-201ENST00000392415 EYA1Q99502 592 aa28.16■■■□□ 2.1
UBE2E3-201ENST00000392415 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
UBE2E3-201ENST00000392415 TXNRD1Q16881 649 aa28.14■■■□□ 2.09
UBE2E3-201ENST00000392415 LRP5O75197 1615 aa28.11■■■□□ 2.09
UBE2E3-201ENST00000392415 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.11■■■□□ 2.09
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.1■■■□□ 2.09
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.1■■■□□ 2.09
UBE2E3-201ENST00000392415 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.1■■■□□ 2.09
UBE2E3-201ENST00000392415 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
UBE2E3-201ENST00000392415 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
UBE2E3-201ENST00000392415 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP27B1O15528 508 aa28.06■■■□□ 2.08
UBE2E3-201ENST00000392415 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.06■■■□□ 2.08
UBE2E3-201ENST00000392415 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
UBE2E3-201ENST00000392415 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.04■■■□□ 2.08
UBE2E3-201ENST00000392415 SPG7Q9UQ90 795 aa28.03■■■□□ 2.08
UBE2E3-201ENST00000392415 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
UBE2E3-201ENST00000392415 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.02■■■□□ 2.08
UBE2E3-201ENST00000392415 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC15A2Q16348 729 aa27.99■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.99■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 STK32BQ9NY57 414 aa27.99■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.98■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 PAPPAQ13219 1627 aa27.98■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 LY75O60449 1722 aa27.98■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 MTHFSP49914 203 aa27.97■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.97■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 CASZ1Q86V15 1759 aa27.96■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 IL13P35225 146 aa27.95■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGB4P16144 1822 aa27.95■■■□□ 2.07
UBE2E3-201ENST00000392415 IFNL2Q8IZJ0 200 aa27.94■■■□□ 2.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PHKG2P15735 406 aa27.93■■■□□ 2.06
UBE2E3-201ENST00000392415 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.92■■■□□ 2.06
UBE2E3-201ENST00000392415 KDRP35968 1356 aa27.92■■■□□ 2.06
UBE2E3-201ENST00000392415 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.92■■■□□ 2.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
UBE2E3-201ENST00000392415 SPON1Q9HCB6 807 aa27.91■■■□□ 2.06
UBE2E3-201ENST00000392415 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
UBE2E3-201ENST00000392415 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.9■■■□□ 2.06
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF827Q17R98 1081 aa27.89■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 AMOTQ4VCS5 1084 aa27.89■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNQ4P56696 695 aa27.88■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 AKT1S1Q96B36 256 aa27.88■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 PIGBQ92521 554 aa27.87■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 PALLDQ8WX93 1383 aa27.85■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.84■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB7AO95365 584 aa27.83■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.83■■■□□ 2.05
UBE2E3-201ENST00000392415 DCAF5Q96JK2 942 aa27.82■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.8■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 MTFR1LQ9H019 292 aa27.8■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.79■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.78■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 C5P01031 1676 aa27.78■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 HMOX1P09601 288 aa27.78■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.78■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 PTGER2P43116 358 aa27.77■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.77■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.77■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
UBE2E3-201ENST00000392415 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.75■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.74■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 ATG3Q9NT62 314 aa27.73■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa27.72■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP2R1AP30153 589 aa27.72■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 SIK1P57059 783 aa27.72■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.72■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 CABP4P57796 275 aa27.71■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.71■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 CFAP53Q96M91 514 aa27.71■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.7■■■□□ 2.03
UBE2E3-201ENST00000392415 C4BP0C0L5 1744 aa27.7■■■□□ 2.02
UBE2E3-201ENST00000392415 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
UBE2E3-201ENST00000392415 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.67■■■□□ 2.02
UBE2E3-201ENST00000392415 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
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