RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373212.5

SH3BGRL-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL-201ENST00000373212 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 USP21Q9UK80 565 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 FMN1Q68DA7 1419 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 TSC1Q92574 1164 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 GPR37L1O60883 481 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 SULF1Q8IWU6 871 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.32□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 UNC13BO14795 1591 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 RCCD1A6NED2 376 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 BRINP3Q76B58 766 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 ADAMTS2O95450 1211 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 TTC13Q8NBP0 860 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.31□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 PLCG2P16885 1265 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 GJA5P36382 358 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 SEMA3FQ13275 785 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa9.29□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.28□□□□□ -0.92
SH3BGRL-201ENST00000373212 ATF3P18847 181 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 PRSS12P56730 875 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 EP400Q96L91 3159 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 STK32AQ8WU08 396 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 PIK3C2BO00750 1634 aa9.27□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 SLC34A2O95436 690 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 EPS8L1Q8TE68 723 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.26□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 RDH13Q8NBN7 331 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 MBD5Q9P267 1494 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 ERCC3P19447 782 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 SOX11P35716 441 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 PTCH1Q13635 1447 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 ATP9BO43861 1147 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 KDM4AO75164 1064 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 FDX1P10109 184 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 BAG6P46379 1132 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 IER5LQ5T953 404 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 GIPC2Q8TF65 315 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 TCF3P15923 654 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF454Q8N9F8 522 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 SIRT1Q96EB6 747 aa9.23□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 EYA1Q99502 592 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa9.22□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 FOSBP53539 338 aa9.21□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 GUCA2AQ02747 115 aa9.21□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.21□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 NINLQ9Y2I6 1382 aa9.21□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 GLI3P10071 1580 aa9.21□□□□□ -0.93
SH3BGRL-201ENST00000373212 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.21□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 PCDHGC3Q9UN70 934 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 CEP152O94986 1710 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 MST1RQ04912 1400 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 HOXA2O43364 376 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BGRL-201ENST00000373212 DNAJB2P25686 324 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.7 ms