RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 CHD1LQ86WJ1 897 aa29.91■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 LNPKQ9C0E8 428 aa29.91■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.91■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 FOXO3O43524 673 aa29.9■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 KDRP35968 1356 aa29.9■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.89■■■□□ 2.38
AMIGO1-201ENST00000369862 AMPHP49418 695 aa29.88■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA0232Q92628 1395 aa29.88■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 EYA1Q99502 592 aa29.88■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 MCM4P33991 863 aa29.87■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NLRP6P59044 892 aa29.87■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.87■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 RGS12O14924 1447 aa29.87■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 GCC1Q96CN9 775 aa29.86■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.85■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa29.84■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF24Q5T7B8 1368 aa29.84■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.84■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.83■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 HSCBQ8IWL3 235 aa29.83■■■□□ 2.37
AMIGO1-201ENST00000369862 USP54Q70EL1 1684 aa29.82■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM25P49756 843 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 HOXC9P31274 260 aa29.79■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.78■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 NWD1Q149M9 1564 aa29.78■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 ABTB2Q8N961 1025 aa29.77■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 FSD2A1L4K1 749 aa29.76■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 SNX21Q969T3 373 aa29.76■■■□□ 2.36
AMIGO1-201ENST00000369862 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.76■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.76■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa29.75■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.75■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRCP08575 1304 aa29.75■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.75■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.75■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC4A2P04920 1241 aa29.73■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC37A3O60309 1634 aa29.73■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP10DQ9P241 1426 aa29.73■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 MSH6P52701 1360 aa29.72■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 DDIT3P35638 169 aa29.72■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.72■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAK2O60296 914 aa29.72■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.71■■■□□ 2.35
AMIGO1-201ENST00000369862 DCTPP1Q9H773 170 aa29.69■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 G2E3Q7L622 706 aa29.68■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.68■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 LTN1O94822 1766 aa29.68■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 C14orf37Q86TY3 774 aa29.68■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 RTL1A6NKG5 1358 aa29.67■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.67■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 MEIS3Q99687 375 aa29.67■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 CEP85Q6P2H3 762 aa29.65■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
AMIGO1-201ENST00000369862 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa29.63■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.63■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 IL17REQ8NFR9 667 aa29.63■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP3K5Q99683 1374 aa29.62■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 NFAT5O94916 1531 aa29.62■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 F6X3S4 739 aa29.62■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa29.61■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.61■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.6■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 KIF2CQ99661 725 aa29.6■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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AMIGO1-201ENST00000369862 MRE11P49959 708 aa29.6■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
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AMIGO1-201ENST00000369862 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.59■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 IP6K1Q92551 441 aa29.58■■■□□ 2.33
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.57■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 ARXQ96QS3 562 aa29.57■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 PSME1Q06323 249 aa29.56■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.55■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 GBP4Q96PP9 640 aa29.55■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 STK31Q9BXU1 1019 aa29.55■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 CCT4P50991 539 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 PANK2Q9BZ23 570 aa29.54■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.53■■■□□ 2.32
AMIGO1-201ENST00000369862 NBPF4Q96M43 638 aa29.53■■■□□ 2.32
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