RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 MAP3K5Q99683 1374 aa23.19■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 CRB1P82279 1406 aa23.18■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 CARD10Q9BWT7 1032 aa23.18■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 NRAPQ86VF7 1730 aa23.17■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 GNAT3A8MTJ3 354 aa23.17■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 C8orf37Q96NL8 207 aa23.17■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.17■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 IL16Q14005 1332 aa23.17■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.17■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.16■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.15■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
LTV1-201ENST00000367576 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.13■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.13■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 SLIT2O94813 1529 aa23.13■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.12■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 NGLY1Q96IV0 654 aa23.12■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 LRRC37A3O60309 1634 aa23.12■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.11■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.11■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 IL2RBP14784 551 aa23.11■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.11■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 IFT57Q9NWB7 429 aa23.11■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 SPG7Q9UQ90 795 aa23.11■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 GNAI1P63096 354 aa23.1■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.1■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 IL17REQ8NFR9 667 aa23.1■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 LGR6Q9HBX8 967 aa23.09■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 MBIPQ9NS73 344 aa23.09■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.09■■□□□ 1.29
LTV1-201ENST00000367576 ZNF853P0CG23 659 aa23.08■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 CFAP44Q96MT7 982 aa23.08■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.07■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 PHKG2P15735 406 aa23.06■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.287e-8■■■■■ 28.3
LTV1-201ENST00000367576 CYP27B1O15528 508 aa23.05■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.05■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 BCL9LQ86UU0 1499 aa23.04■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.04■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 DISP2A7MBM2 1401 aa23.04■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
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LTV1-201ENST00000367576 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.04■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.04■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.03■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.03■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa23.03■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa23.03■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.03■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.03■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 CHL1O00533 1208 aa23.02■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 NEFLP07196 543 aa23.02■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.02■■□□□ 1.28
LTV1-201ENST00000367576 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 USP21Q9UK80 565 aa23.01■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 TEFQ10587 303 aa23.01■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.99■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 KRT24Q2M2I5 525 aa22.99■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 AFF2P51816 1311 aa22.99■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 BCAR3O75815 825 aa22.98■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 FKBP8Q14318 412 aa22.98■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 TSPYL6Q8N831 410 aa22.98■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.98■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 PLIN1O60240 522 aa22.98■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.98■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.97■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 VPS72Q15906 364 aa22.97■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.96■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 DCAF5Q96JK2 942 aa22.96■■□□□ 1.27
LTV1-201ENST00000367576 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
LTV1-201ENST00000367576 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
LTV1-201ENST00000367576 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
LTV1-201ENST00000367576 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
LTV1-201ENST00000367576 TNS2Q63HR2 1409 aa22.94■■□□□ 1.26
LTV1-201ENST00000367576 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
LTV1-201ENST00000367576 BTBD11A6QL63 1104 aa22.93■■□□□ 1.26
LTV1-201ENST00000367576 KCNQ3O43525 872 aa22.93■■□□□ 1.26
LTV1-201ENST00000367576 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.92■■□□□ 1.26
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