RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 BACH2Q9BYV9 841 aa3.63□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 C19orf67A6NJJ6 358 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 SERPINB4P48594 390 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CHADLQ6NUI6 762 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PADI6Q6TGC4 694 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CABLES1Q8TDN4 633 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 OCSTAMPQ9BR26 566 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L15C9J2P7 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L10C9JJH3 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L13C9JLJ4 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L12C9JPN9 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L11C9JVI0 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L21D6R901 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L18D6R9N7 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L22D6RA61 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L17D6RBQ6 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L19D6RCP7 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L20D6RJB6 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 ENPP3O14638 875 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 FANCCQ00597 558 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L24Q0WX57 530 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 RELNP78509 3460 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 MYO5BQ9ULV0 1848 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PIK3CDO00329 1044 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 RGS20O76081 388 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 TCEAL1Q15170 157 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 STAG1Q8WVM7 1258 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF592Q92610 1267 aa3.62□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 UGGT1Q9NYU2 1555 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PARNO95453 639 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 TRAF7Q6Q0C0 670 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 FAM174AQ8TBP5 190 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP3.61□□□□□ -1.833e-7■■■■□ 20.9
CCSAP-202ENST00000366686 TTLL13PA6NNM8 815 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 ICMTO60725 284 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 SERINC3Q13530 473 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 SDE2Q6IQ49 451 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 TGIF2Q9GZN2 237 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 LRP5O75197 1615 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 TIE1P35590 1138 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 SWI5Q1ZZU3 235 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa3.61□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP99D6REC4 459 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 SCNN1AP37088 669 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC181Q5TID7 509 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM106CQ9BVX2 250 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 KNDC1Q76NI1 1749 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 RGL4Q8IZJ4 473 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CERKQ8TCT0 537 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC144BQ3MJ40 725 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 SIX5Q8N196 739 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 TMC2Q8TDI7 906 aa3.6□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 BRCA2P51587 3418 aa3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 AP1G2O75843 785 aa3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PRM3Q9NNZ6 103 aa3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 DIP2AQ14689 1571 aa3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 VIL1P09327 827 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 JAZF1Q86VZ6 243 aa3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 PLB1Q6P1J6 1458 aa3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 MYOM1P52179 1685 aa3.59□□□□□ -1.83
CCSAP-202ENST00000366686 HOXA2O43364 376 aa3.59□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 LRRN4Q8WUT4 740 aa3.59□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 COL26A1Q96A83 441 aa3.59□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 EVI5LQ96CN4 794 aa3.59□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa3.59□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PEAK1Q9H792 1746 aa3.59□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 ERCC6Q03468 1493 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L3A6NCW0 530 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L4A6NCW7 530 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L2Q6R6M4 530 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 USP17L1Q7RTZ2 530 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 REV3LO60673 3130 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 P4HBP07237 508 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CDCA8Q53HL2 280 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 MAMSTRQ6ZN01 415 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 JPH4Q96JJ6 628 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 NHSL1Q5SYE7 1610 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 PRSS12P56730 875 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CLDN10P78369 228 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 TAF7LQ5H9L4 462 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 SLAIN1Q8ND83 568 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 RBCK1Q9BYM8 510 aa3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 FHAD1B1AJZ9 1412 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 EFCAB6Q5THR3 1501 aa3.57□□□□□ -1.84
CCSAP-202ENST00000366686 DAB2P98082 770 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms