RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

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Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 CRB1P82279 1406 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 BECN1Q14457 450 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 NFKBIBQ15653 356 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 KRT24Q2M2I5 525 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 ABTB2Q8N961 1025 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 LNPKQ9C0E8 428 aa22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 HOXC9P31274 260 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 NWD1Q149M9 1564 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 KIAA0232Q92628 1395 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 GCC1Q96CN9 775 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 LTN1O94822 1766 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 RGS12O14924 1447 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 C14orf37Q86TY3 774 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 LRRC37A3O60309 1634 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 NFAT5O94916 1531 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-202ENST00000323081 RTL1A6NKG5 1358 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 GSE1Q14687 1217 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 PTPRCP08575 1304 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 SLC4A2P04920 1241 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 PSME1Q06323 249 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 IP6K1Q92551 441 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS1-202ENST00000323081 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 ORAI2Q96SN7 254 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 MSH6P52701 1360 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 DCTPP1Q9H773 170 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 MAP3K5Q99683 1374 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 IL17REQ8NFR9 667 aa22■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 ATP10DQ9P241 1426 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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SPNS1-202ENST00000323081 G2E3Q7L622 706 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 KCNH5Q8NCM2 988 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 IL27Q8NEV9 243 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 NBPF4Q96M43 638 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 MEIS3Q99687 375 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 CEP85Q6P2H3 762 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
SPNS1-202ENST00000323081 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 SLIT3O75094 1523 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 F6X3S4 739 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 STK31Q9BXU1 1019 aa21.94■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.93■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 GCP02774 474 aa21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 HSCBQ8IWL3 235 aa21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 ARHGEF25Q86VW2 580 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 CACNA1FO60840 1977 aa21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SPNS1-202ENST00000323081 KIF1AQ12756 1690 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-202ENST00000323081 CDC45O75419 566 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-202ENST00000323081 NECTIN2Q92692 538 aa21.89■■□□□ 1.09
SPNS1-202ENST00000323081 PLEKHG5O94827 1062 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-202ENST00000323081 APBB1O00213 710 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-202ENST00000323081 FLIIQ13045 1269 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-202ENST00000323081 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.88■■□□□ 1.09
SPNS1-202ENST00000323081 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-202ENST00000323081 TTC22Q5TAA0 569 aa21.87■■□□□ 1.09
SPNS1-202ENST00000323081 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.87■■□□□ 1.09
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