RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319511.6

TMUB2-201, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMUB2, Length 2,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-201ENST00000319511 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.25■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 GOLIM4O00461 696 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 PSMD1Q99460 953 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 CDK19Q9BWU1 502 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 SMC4Q9NTJ3 1288 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 C3P01024 1663 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 APAF1O14727 1248 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 TERF2IPQ9NYB0 399 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa16.24■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 TMEM2Q9UHN6 1383 aa16.23■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 RNF217Q8TC41 542 aa16.23■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 TSC1Q92574 1164 aa16.23■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 CCDC172P0C7W6 258 aa16.23■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 METP08581 1390 aa16.23■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.22■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 ADGRB2O60241 1585 aa16.22■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 SLFN14P0C7P3 912 aa16.22■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 MTHFSP49914 203 aa16.22■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 TMEM132AQ24JP5 1023 aa16.21■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 CFAP53Q96M91 514 aa16.21■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.21■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 NASPP49321 788 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TMUB2-201ENST00000319511 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.2■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 RUNDC1Q96C34 613 aa16.19■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 WAPLQ7Z5K2 1190 aa16.19■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 PDCL2Q8N4E4 241 aa16.19■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 MON2Q7Z3U7 1717 aa16.19■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.18■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 AKAP12Q02952 1782 aa16.18■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 FYB1O15117 783 aa16.18■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 SLIT1O75093 1534 aa16.18■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.18■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 USP19O94966 1318 aa16.17■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa16.17■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.184e-14■■■□□ 14.8
TMUB2-201ENST00000319511 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.17■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 DDX11L8A8MPP1 907 aa16.17■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 FEZ1Q99689 392 aa16.17■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.17■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 NBPF11Q86T75 865 aa16.16■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 MCM5P33992 734 aa16.16■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 GGNBP2Q9H3C7 697 aa16.16■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 CABP1Q9NZU7 370 aa16.16■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 RAI14Q9P0K7 980 aa16.16■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 RSPH14Q9UHP6 348 aa16.16■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 WASLO00401 505 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 OGFRQ9NZT2 677 aa16.15■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 ITSN1Q15811 1721 aa16.15■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 TRERF1Q96PN7 1200 aa16.15■□□□□ 0.18
TMUB2-201ENST00000319511 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.14■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 CCDC27Q2M243 656 aa16.14■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 PRIMPOLQ96LW4 560 aa16.14■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa16.14■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 GPATCH11Q8N954 259 aa16.14■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.14■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 PLIN1O60240 522 aa16.13■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 SGSM3Q96HU1 749 aa16.13■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa16.13■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 CRBNQ96SW2 442 aa16.13■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 TTC36A6NLP5 189 aa16.12■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 ANAPC15P60006 121 aa16.12■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 TCP11L2Q8N4U5 519 aa16.12■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 ICE2Q659A1 982 aa16.11■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 TXNDC2Q86VQ3 553 aa16.11■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 DIP2AQ14689 1571 aa16.11■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 TERF2Q15554 542 aa16.11■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 WDR63Q8IWG1 891 aa16.11■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.1■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 KIF16BQ96L93 1317 aa16.1■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.1■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 LTKP29376 864 aa16.1■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.1■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 CTR9Q6PD62 1173 aa16.1■□□□□ 0.17
TMUB2-201ENST00000319511 TMX1Q9H3N1 280 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms