RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 NEMFO60524 1076 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 SRGAP3O43295 1099 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 NFE2L2Q16236 605 aa22.32■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 CTAGE5O15320 804 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 MCM5P33992 734 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 DAPK1P53355 1430 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 EZRP15311 586 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 AACSQ86V21 672 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 CDK19Q9BWU1 502 aa22.31■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 INCENPQ9NQS7 918 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 ANO10Q9NW15 660 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.3■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.166e-6■■□□□ 14.5
UBE2N-201ENST00000318066 STK3Q13188 491 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 MAP9Q49MG5 647 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 TAF4BQ92750 862 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.29■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.28■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 KIF18AQ8NI77 898 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 PTPN14Q15678 1187 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 CAVIN2O95810 425 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 CABP4P57796 275 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 AFAP1Q8N556 730 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 CABP1Q9NZU7 370 aa22.27■■□□□ 1.16
UBE2N-201ENST00000318066 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.27■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 SYNJ1O43426 1573 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 DESP17661 470 aa22.26■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 MTMR7Q9Y216 660 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 CRACR2AQ9BSW2 395 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.25■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 CFAP100Q494V2 611 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.24■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 HECW1Q76N89 1606 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 MX1P20591 662 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 CETN2P41208 172 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 FAM107BQ9H098 131 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 KIAA1328Q86T90 577 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 TIAM1Q13009 1591 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.23■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 PRXQ9BXM0 1461 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC102AQ96A19 550 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 SYCE3A1L190 88 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 POTEB2H3BUK9 544 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 ZMYND15Q9H091 742 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 TDO2P48775 406 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 GSDMDP57764 484 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 SIL1Q9H173 461 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2N-201ENST00000318066 SHTN1A0MZ66 631 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 KIF5CO60282 957 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 KDM4AO75164 1064 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 SPA17Q15506 151 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2N-201ENST00000318066 NESP48681 1621 aa22.19■■□□□ 1.14
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