RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317058.7

SGF29-201, Transcript of SAGA complex associated factor 29, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGF29, Length 1,153 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29-201ENST00000317058 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.03■■□□□ 1.28
SGF29-201ENST00000317058 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SGF29-201ENST00000317058 ANP32CO43423 234 aa23.03■■□□□ 1.28
SGF29-201ENST00000317058 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SGF29-201ENST00000317058 KDRP35968 1356 aa23.02■■□□□ 1.28
SGF29-201ENST00000317058 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.02■■□□□ 1.28
SGF29-201ENST00000317058 EP400Q96L91 3159 aa23.02■■□□□ 1.28
SGF29-201ENST00000317058 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.02■■□□□ 1.28
SGF29-201ENST00000317058 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.01■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 SPG7Q9UQ90 795 aa23.01■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 HMOX1P09601 288 aa22.99■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.99■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.99■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 CCDC125Q86Z20 511 aa22.98■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 BCL9O00512 1426 aa22.98■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 SBF2Q86WG5 1849 aa22.96■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.96■■□□□ 1.27
SGF29-201ENST00000317058 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 CYP27B1O15528 508 aa22.92■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 TRIM37O94972 964 aa22.92■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.92■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.92■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 FCHSD2O94868 740 aa22.9■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.9■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 NHSQ6T4R5 1651 aa22.9■■□□□ 1.26
SGF29-201ENST00000317058 PHKG2P15735 406 aa22.89■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.88■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 PRKAR2BP31323 418 aa22.88■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.88■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.88■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 NEFMP07197 916 aa22.86■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 BAG6P46379 1132 aa22.85■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.85■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 APBA3O96018 575 aa22.84■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 KCNQ2O43526 872 aa22.83■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.83■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SGF29-201ENST00000317058 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 DCAF5Q96JK2 942 aa22.82■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 BTAF1O14981 1849 aa22.82■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.82■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 ITGB4P16144 1822 aa22.81■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.81■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.8■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 MRS2Q9HD23 443 aa22.8■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.79■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.79■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.78■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.78■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 CCDC184Q52MB2 194 aa22.78■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.78■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.78■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 PLSCR1O15162 318 aa22.77■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.77■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.77■■□□□ 1.24
SGF29-201ENST00000317058 MAP3K5Q99683 1374 aa22.76■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.76■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.76■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.74■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 CABP4P57796 275 aa22.73■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 RUNDC1Q96C34 613 aa22.73■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.73■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 NFE2L2Q16236 605 aa22.72■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 PIGBQ92521 554 aa22.72■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.72■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.71■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 LGR6Q9HBX8 967 aa22.71■■□□□ 1.23
SGF29-201ENST00000317058 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 RREB1Q92766 1687 aa22.7■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 MRC1P22897 1456 aa22.68■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.68■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.68■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 LY75O60449 1722 aa22.68■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 CCER2I3L3R5 266 aa22.67■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 TEFQ10587 303 aa22.67■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 IL17REQ8NFR9 667 aa22.67■■□□□ 1.22
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