RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.9■■□□□ 1.26
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USP48-201ENST00000308271 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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USP48-201ENST00000308271 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.77■■□□□ 1.24
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USP48-201ENST00000308271 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.76■■□□□ 1.23
USP48-201ENST00000308271 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.76■■□□□ 1.23
USP48-201ENST00000308271 SMARCE1Q969G3 411 aa22.76■■□□□ 1.23
USP48-201ENST00000308271 ERLIN1O75477 346 aa22.75■■□□□ 1.23
USP48-201ENST00000308271 CAVIN2O95810 425 aa22.75■■□□□ 1.23
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