RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301281.10

UBXN6-201, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN6, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-201ENST00000301281 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.66■■□□□ 1.7
UBXN6-201ENST00000301281 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
UBXN6-201ENST00000301281 SKAP1Q86WV1 359 aa25.66■■□□□ 1.7
UBXN6-201ENST00000301281 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.66■■□□□ 1.7
UBXN6-201ENST00000301281 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
UBXN6-201ENST00000301281 PXDNQ92626 1479 aa25.66■■□□□ 1.7
UBXN6-201ENST00000301281 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.65■■□□□ 1.7
UBXN6-201ENST00000301281 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
UBXN6-201ENST00000301281 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 PLEKHG5O94827 1062 aa25.64■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.64■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 NBPF4Q96M43 638 aa25.64■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 NCAPD2Q15021 1401 aa25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.62■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 IGHDP01880 384 aa25.62■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.62■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 KIAA0232Q92628 1395 aa25.61■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 MAP3K5Q99683 1374 aa25.61■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 RGPD5Q99666 1765 aa25.61■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.6■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 KRT24Q2M2I5 525 aa25.59■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.59■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.58■■□□□ 1.69
UBXN6-201ENST00000301281 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.57■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.57■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.57■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.56■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.55■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.55■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 COL18A1P39060 1754 aa25.55■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 BRINP3Q76B58 766 aa25.55■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.55■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 TSPYL4Q9UJ04 414 aa25.54■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 IL17REQ8NFR9 667 aa25.53■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.53■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 ABCC4O15439 1325 aa25.52■■□□□ 1.68
UBXN6-201ENST00000301281 ERBB3P21860 1342 aa25.51■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 ABCC6O95255 1503 aa25.51■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.5■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.49■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 RGS12O14924 1447 aa25.48■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 CABLES1Q8TDN4 633 aa25.47■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 PDE4AP27815 886 aa25.47■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 SLAIN2Q9P270 581 aa25.46■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
UBXN6-201ENST00000301281 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 BACH2Q9BYV9 841 aa25.45■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 RGS3P49796 1198 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 BABAM1Q9NWV8 329 aa25.44■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 CPDO75976 1380 aa25.43■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 ABCA3Q99758 1704 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.42■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.41■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 LGR6Q9HBX8 967 aa25.4■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.4■■□□□ 1.66
UBXN6-201ENST00000301281 PTPRCP08575 1304 aa25.39■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 CHRNA2Q15822 529 aa25.37■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 MEGF6O75095 1541 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 SLC4A2P04920 1241 aa25.36■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.35■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.35■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.35■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.34■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 CACNA1FO60840 1977 aa25.34■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 G2E3Q7L622 706 aa25.33■■□□□ 1.65
UBXN6-201ENST00000301281 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 C8orf34Q49A92 452 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 SMC5Q8IY18 1101 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.32■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 FAM161AQ3B820 660 aa25.31■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 TEFQ10587 303 aa25.31■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.3■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.3■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.3■■□□□ 1.64
UBXN6-201ENST00000301281 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms