RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF827Q17R98 1081 aa27.32■■□□□ 1.96
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CXCL3-201ENST00000296026 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
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CXCL3-201ENST00000296026 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa27.29■■□□□ 1.96
CXCL3-201ENST00000296026 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.29■■□□□ 1.96
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CXCL3-201ENST00000296026 INSRP06213 1382 aa27.29■■□□□ 1.96
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CXCL3-201ENST00000296026 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.28■■□□□ 1.96
CXCL3-201ENST00000296026 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL3-201ENST00000296026 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.27■■□□□ 1.96
CXCL3-201ENST00000296026 NSD2O96028 1365 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL3-201ENST00000296026 KIF24Q5T7B8 1368 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL3-201ENST00000296026 AKT1S1Q96B36 256 aa27.26■■□□□ 1.95
CXCL3-201ENST00000296026 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
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CXCL3-201ENST00000296026 KCNQ4P56696 695 aa27.24■■□□□ 1.95
CXCL3-201ENST00000296026 SYT17Q9BSW7 474 aa27.23■■□□□ 1.95
CXCL3-201ENST00000296026 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa27.23■■□□□ 1.95
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CXCL3-201ENST00000296026 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.18■■□□□ 1.94
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CXCL3-201ENST00000296026 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa27.18■■□□□ 1.94
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CXCL3-201ENST00000296026 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.18■■□□□ 1.94
CXCL3-201ENST00000296026 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.18■■□□□ 1.94
CXCL3-201ENST00000296026 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
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CXCL3-201ENST00000296026 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-201ENST00000296026 CYP27B1O15528 508 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 MAP3K5Q99683 1374 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 NCAPD2Q15021 1401 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 POLD1P28340 1107 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.1■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 POLKQ9UBT6 870 aa27.09■■□□□ 1.93
CXCL3-201ENST00000296026 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 KLHL34Q8N239 644 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 EYA1Q99502 592 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 PALLDQ8WX93 1383 aa27.07■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 C5P01031 1676 aa27.06■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 SPG7Q9UQ90 795 aa27.06■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 ITGB4P16144 1822 aa27.05■■□□□ 1.92
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CXCL3-201ENST00000296026 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.02■■□□□ 1.92
CXCL3-201ENST00000296026 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 PANK3Q9H999 370 aa27.01■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP27.01■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 PIGBQ92521 554 aa27■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 GPR162Q16538 588 aa26.99■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 CHD4Q14839 1912 aa26.97■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 MSL1Q68DK7 614 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 C4BP0C0L5 1744 aa26.96■■□□□ 1.91
CXCL3-201ENST00000296026 PHKG2P15735 406 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.95■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.94■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 AK7Q96M32 723 aa26.93■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.91■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.9■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.9■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 SIK1P57059 783 aa26.9■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.9■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.89■■□□□ 1.9
CXCL3-201ENST00000296026 UBR3Q6ZT12 1888 aa26.88■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 MORC1Q86VD1 984 aa26.88■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 PHF14O94880 888 aa26.87■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 SMIM5Q71RC9 77 aa26.87■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.87■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 ATG3Q9NT62 314 aa26.85■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.85■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 ATP6V1AP38606 617 aa26.84■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 ITPK1Q13572 414 aa26.84■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 SSFA2P28290 1259 aa26.83■■□□□ 1.89
CXCL3-201ENST00000296026 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.88
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