RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295925.5

CCNL1-201, Transcript of cyclin L1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNL1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1-201ENST00000295925 EP400Q96L91 3159 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 RALBP1Q15311 655 aa22.05■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 TRIM37O94972 964 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 HMOX1P09601 288 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNL1-201ENST00000295925 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CCNL1-201ENST00000295925 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22■■□□□ 1.11
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CCNL1-201ENST00000295925 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNL1-201ENST00000295925 KDRP35968 1356 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNL1-201ENST00000295925 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNL1-201ENST00000295925 NHSQ6T4R5 1651 aa21.98■■□□□ 1.11
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CCNL1-201ENST00000295925 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNL1-201ENST00000295925 CYP27B1O15528 508 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNL1-201ENST00000295925 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.95■■□□□ 1.1
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CCNL1-201ENST00000295925 NUDCQ9Y266 331 aa21.95■■□□□ 1.1
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CCNL1-201ENST00000295925 KCNQ2O43526 872 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNL1-201ENST00000295925 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CCNL1-201ENST00000295925 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.13e-11■□□□□ 10.1
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CCNL1-201ENST00000295925 APBA3O96018 575 aa21.92■■□□□ 1.1
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CCNL1-201ENST00000295925 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
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CCNL1-201ENST00000295925 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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CCNL1-201ENST00000295925 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CCNL1-201ENST00000295925 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.89■■□□□ 1.09
CCNL1-201ENST00000295925 IFNL2Q8IZJ0 200 aa21.89■■□□□ 1.09
CCNL1-201ENST00000295925 ITGB4P16144 1822 aa21.89■■□□□ 1.09
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CCNL1-201ENST00000295925 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.88■■□□□ 1.09
CCNL1-201ENST00000295925 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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CCNL1-201ENST00000295925 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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CCNL1-201ENST00000295925 RREB1Q92766 1687 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 FCHSD2O94868 740 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.81■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.81■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.8■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 CCDC184Q52MB2 194 aa21.8■■□□□ 1.08
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CCNL1-201ENST00000295925 GAS2L2Q8NHY3 880 aa21.78■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.77■■□□□ 1.08
CCNL1-201ENST00000295925 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.76■■□□□ 1.07
CCNL1-201ENST00000295925 MAP3K5Q99683 1374 aa21.76■■□□□ 1.07
CCNL1-201ENST00000295925 PLSCR1O15162 318 aa21.76■■□□□ 1.07
CCNL1-201ENST00000295925 PIGBQ92521 554 aa21.76■■□□□ 1.07
CCNL1-201ENST00000295925 LY75O60449 1722 aa21.75■■□□□ 1.07
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CCNL1-201ENST00000295925 LGR6Q9HBX8 967 aa21.75■■□□□ 1.07
CCNL1-201ENST00000295925 MRS2Q9HD23 443 aa21.75■■□□□ 1.07
CCNL1-201ENST00000295925 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.75■■□□□ 1.07
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CCNL1-201ENST00000295925 PROM2Q8N271 834 aa21.72■■□□□ 1.07
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CCNL1-201ENST00000295925 KCNQ4P56696 695 aa21.71■■□□□ 1.07
CCNL1-201ENST00000295925 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CCNL1-201ENST00000295925 MRC1P22897 1456 aa21.71■■□□□ 1.07
CCNL1-201ENST00000295925 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.7■■□□□ 1.06
CCNL1-201ENST00000295925 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.7■■□□□ 1.06
CCNL1-201ENST00000295925 IL17REQ8NFR9 667 aa21.68■■□□□ 1.06
CCNL1-201ENST00000295925 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.68■■□□□ 1.06
CCNL1-201ENST00000295925 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
CCNL1-201ENST00000295925 DCTN1Q14203 1278 aa21.67■■□□□ 1.06
CCNL1-201ENST00000295925 NFE2L2Q16236 605 aa21.67■■□□□ 1.06
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