RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 CRBNQ96SW2 442 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.1□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCC6O95255 1503 aa12.09□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
RABGEF1-201ENST00000284957 LRRC37A3O60309 1634 aa12.08□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPYL6Q8N831 410 aa12.08□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 CHL1O00533 1208 aa12.08□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 SSH1Q8WYL5 1049 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 MAP3K5Q99683 1374 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 VAMP4O75379 141 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 IL17REQ8NFR9 667 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 TNNQ9UQP3 1299 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 PDE3AQ14432 1141 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 SMC4Q9NTJ3 1288 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 RLBP1P12271 317 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 KRT24Q2M2I5 525 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 PANK1Q8TE04 598 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa12.04□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDH1L2Q3SY69 923 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF428Q96B54 188 aa12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 MEGF6O75095 1541 aa12.02□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.02□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 ANP32EQ9BTT0 268 aa12.02□□□□□ -0.48
RABGEF1-201ENST00000284957 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 CANXP27824 592 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 LGR6Q9HBX8 967 aa12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM27P14373 513 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 COG6Q9Y2V7 657 aa12.01□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR17Q8IZU2 1322 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa12□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 PHLPP1O60346 1717 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 KIF16BQ96L93 1317 aa11.99□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 TOM1O60784 492 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.491e-7■■□□□ 13.3
RABGEF1-201ENST00000284957 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 PIP4K2BP78356 416 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 MVPQ14764 893 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-201ENST00000284957 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 PHKG2P15735 406 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 STRN4Q9NRL3 753 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 CYP27B1O15528 508 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGAP45Q92619 1136 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 CARD10Q9BWT7 1032 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM2BQ8NHM5 1336 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 SPG7Q9UQ90 795 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 KCNQ3O43525 872 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 BTG4Q9NY30 223 aa11.95□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM57Q8N5G2 664 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 MS4A1P11836 297 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 TEFQ10587 303 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms