RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270645.7

RCN3-201, Transcript of reticulocalbin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCN3, Length 1,859 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3-201ENST00000270645 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.46■■□□□ 1.83
RCN3-201ENST00000270645 MS4A1P11836 297 aa26.45■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.44■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.44■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.43■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 ANKRD24Q8TF21 1146 aa26.42■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 KIF16BQ96L93 1317 aa26.42■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.42■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 AAMPQ13685 434 aa26.42■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.42■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 NCAPD2Q15021 1401 aa26.41■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 TRIM27P14373 513 aa26.41■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.41■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
RCN3-201ENST00000270645 MAP3K5Q99683 1374 aa26.39■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 KIAA0232Q92628 1395 aa26.38■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 RGPD2P0DJD1 1756 aa26.38■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.36■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 IL17REQ8NFR9 667 aa26.36■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 LRRC37A3O60309 1634 aa26.35■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 ERBB3P21860 1342 aa26.34■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.34■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.34■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.34■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa26.33■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 TSPYL4Q9UJ04 414 aa26.33■■□□□ 1.81
RCN3-201ENST00000270645 KRT24Q2M2I5 525 aa26.32■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 COL18A1P39060 1754 aa26.31■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 RGPD5Q99666 1765 aa26.31■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 CPDO75976 1380 aa26.31■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.3■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 IGHDP01880 384 aa26.3■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 BABAM1Q9NWV8 329 aa26.3■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 ABCC6O95255 1503 aa26.29■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.29■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.28■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.28■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.28■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.28■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.27■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.27■■□□□ 1.8
RCN3-201ENST00000270645 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 CHRNA2Q15822 529 aa26.25■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 LGR6Q9HBX8 967 aa26.23■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 NLRP2Q9NX02 1062 aa26.23■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 SKAP1Q86WV1 359 aa26.21■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 ABCC4O15439 1325 aa26.21■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.21■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.21■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.21■■□□□ 1.79
RCN3-201ENST00000270645 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.2■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.2■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.19■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.18■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa26.17■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa26.16■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.16■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 PTPRCP08575 1304 aa26.15■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 SLC4A2P04920 1241 aa26.15■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.14■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 TEFQ10587 303 aa26.14■■□□□ 1.78
RCN3-201ENST00000270645 RGS12O14924 1447 aa26.13■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.12■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 MEGF6O75095 1541 aa26.12■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 ABCA3Q99758 1704 aa26.12■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 SPG7Q9UQ90 795 aa26.11■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.09■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 BTBD11A6QL63 1104 aa26.09■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 STK31Q9BXU1 1019 aa26.09■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.09■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.08■■□□□ 1.77
RCN3-201ENST00000270645 G2E3Q7L622 706 aa26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms