RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 USP48Q86UV5 1035 aa25.74■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 ZBTB22O15209 634 aa25.74■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.74■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 APBB1O00213 710 aa25.73■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 TAF3Q5VWG9 929 aa25.73■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.73■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 KIAA1524Q8TCG1 905 aa25.73■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 TET3O43151 1660 aa25.73■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 KCNF1Q9H3M0 494 aa25.72■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 CTIFO43310 598 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 ERC2O15083 957 aa25.71■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.71■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 FEZ1Q99689 392 aa25.71■■□□□ 1.71
ODC1-201ENST00000234111 KDM4AO75164 1064 aa25.7■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.7■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 CUL4AQ13619 759 aa25.7■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.69■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 VGLL3A8MV65 326 aa25.69■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.69■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 OGFRQ9NZT2 677 aa25.69■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 CABP2Q9NPB3 220 aa25.67■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 IFT172Q9UG01 1749 aa25.66■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 AP5Z1O43299 807 aa25.66■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 SPC24Q8NBT2 197 aa25.66■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 MROH2AA6NES4 1674 aa25.65■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.65■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 MCM2P49736 904 aa25.65■■□□□ 1.7
ODC1-201ENST00000234111 MX1P20591 662 aa25.64■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 KIF1BO60333 1816 aa25.63■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 PALD1Q9ULE6 856 aa25.63■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 DEPDC5O75140 1603 aa25.63■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 EVC2Q86UK5 1308 aa25.63■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 PRKAR2BP31323 418 aa25.63■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.62■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 ABCC1P33527 1531 aa25.62■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.62■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 A0A1W2PP64 1363 aa25.62■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.61■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 FANCAO15360 1455 aa25.61■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 KIF3BO15066 747 aa25.61■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 MBIPQ9NS73 344 aa25.6■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 ATP10DQ9P241 1426 aa25.6■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.6■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.6■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 SLFN14P0C7P3 912 aa25.6■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 TCHHQ07283 1943 aa25.59■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.59■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.59■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 ADGRB1O14514 1584 aa25.59■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.59■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 CEP85Q6P2H3 762 aa25.58■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.58■■□□□ 1.69
ODC1-201ENST00000234111 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 C8orf58Q8NAV2 365 aa25.58■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.57■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 FCHSD2O94868 740 aa25.57■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.57■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.57■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.57■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 FYB1O15117 783 aa25.56■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 TPM3P06753 285 aa25.56■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 KCNJ4P48050 445 aa25.55■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 GNAI1P63096 354 aa25.55■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 RTL1A6NKG5 1358 aa25.55■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 PTGS1P23219 599 aa25.54■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 UBE2HP62256 183 aa25.54■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.54■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 IFT57Q9NWB7 429 aa25.54■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.54■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 NFE2L2Q16236 605 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 HMOX1P09601 288 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 MCCP23508 829 aa25.53■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.52■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
ODC1-201ENST00000234111 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms