RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.27■■■□□ 2.28
SLC25A39-201ENST00000225308 SBF2Q86WG5 1849 aa29.25■■■□□ 2.27
SLC25A39-201ENST00000225308 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.24■■■□□ 2.27
SLC25A39-201ENST00000225308 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SLC25A39-201ENST00000225308 KAT6BQ8WYB5 2073 aa29.22■■■□□ 2.27
SLC25A39-201ENST00000225308 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.272e-6■■■■■ 32.2
SLC25A39-201ENST00000225308 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa29.22■■■□□ 2.27
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM196AQ6ZSG2 479 aa29.21■■■□□ 2.27
SLC25A39-201ENST00000225308 BCL9O00512 1426 aa29.2■■■□□ 2.27
SLC25A39-201ENST00000225308 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 HMOX1P09601 288 aa29.2■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.17■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 NUDCQ9Y266 331 aa29.16■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 CYP27B1O15528 508 aa29.15■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 SPG7Q9UQ90 795 aa29.14■■■□□ 2.26
SLC25A39-201ENST00000225308 ANP32CO43423 234 aa29.12■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 DOT1LQ8TEK3 1739 aa29.12■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 NHSQ6T4R5 1651 aa29.12■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM37O94972 964 aa29.11■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC125Q86Z20 511 aa29.09■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.09■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.09■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.09■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
SLC25A39-201ENST00000225308 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.07■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 PHKG2P15735 406 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNQ2O43526 872 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 PRKAR2BP31323 418 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.05■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 BTAF1O14981 1849 aa29.04■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 FCHSD2O94868 740 aa29.04■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 ITGB4P16144 1822 aa29.04■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC184Q52MB2 194 aa29.02■■■□□ 2.24
SLC25A39-201ENST00000225308 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 PHACTR3Q96KR7 559 aa29.01■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.99■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.98■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.98■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.97■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 APBA3O96018 575 aa28.97■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.95■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 BAG6P46379 1132 aa28.95■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.95■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.95■■■□□ 2.23
SLC25A39-201ENST00000225308 DCAF5Q96JK2 942 aa28.94■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP28.93■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.93■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.92■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.91■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 MRS2Q9HD23 443 aa28.91■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 RREB1Q92766 1687 aa28.9■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP3K5Q99683 1374 aa28.9■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 CAMKK2Q96RR4 588 aa28.9■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 PLSCR1O15162 318 aa28.89■■■□□ 2.22
SLC25A39-201ENST00000225308 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.87■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 PIGBQ92521 554 aa28.87■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 MRC1P22897 1456 aa28.87■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 LY75O60449 1722 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 LGR6Q9HBX8 967 aa28.86■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 NEFMP07197 916 aa28.85■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.85■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.85■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.84■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.83■■■□□ 2.21
SLC25A39-201ENST00000225308 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
SLC25A39-201ENST00000225308 PROM2Q8N271 834 aa28.81■■■□□ 2.2
SLC25A39-201ENST00000225308 IL17REQ8NFR9 667 aa28.81■■■□□ 2.2
SLC25A39-201ENST00000225308 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC25A39-201ENST00000225308 CABP4P57796 275 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC25A39-201ENST00000225308 NFE2L2Q16236 605 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC25A39-201ENST00000225308 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC25A39-201ENST00000225308 RUNDC1Q96C34 613 aa28.8■■■□□ 2.2
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.79■■■□□ 2.2
SLC25A39-201ENST00000225308 TXNRD1Q16881 649 aa28.78■■■□□ 2.2
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