RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.04■■□□□ 1.12
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RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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RABGGTA-201ENST00000216840 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.87■■□□□ 1.09
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RABGGTA-201ENST00000216840 STK31Q9BXU1 1019 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.75■■□□□ 1.07
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RABGGTA-201ENST00000216840 TEFQ10587 303 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.71■■□□□ 1.07
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