RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.04■■□□□ 1.12
RABGGTA-201ENST00000216840 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-201ENST00000216840 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.03■■□□□ 1.12
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-201ENST00000216840 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.02■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.02■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC37A3O60309 1634 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.01■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM57Q8N5G2 664 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 DDX19BQ9UMR2 479 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 KIAA0232Q92628 1395 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 NBPF6Q5VWK0 638 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 NBPF4Q96M43 638 aa22■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 MSH6P52701 1360 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHG5O94827 1062 aa21.99■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 PDE4AP27815 886 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 KRT24Q2M2I5 525 aa21.97■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 MAP3K5Q99683 1374 aa21.96■■□□□ 1.11
RABGGTA-201ENST00000216840 RGPD5Q99666 1765 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 BACH2Q9BYV9 841 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.95■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 NCAPD2Q15021 1401 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.94■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 PXDNQ92626 1479 aa21.93■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 IL17REQ8NFR9 667 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.92■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC4O15439 1325 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 RGS3P49796 1198 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.91■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 LMO7Q8WWI1 1683 aa21.89■■□□□ 1.1
RABGGTA-201ENST00000216840 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.89■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 COL18A1P39060 1754 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.87■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 BRINP3Q76B58 766 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RGS12O14924 1447 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ERBB3P21860 1342 aa21.85■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.83■■□□□ 1.09
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM161AQ3B820 660 aa21.83■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MSH5O43196 834 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PTPRCP08575 1304 aa21.82■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 LGR6Q9HBX8 967 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SLAIN2Q9P270 581 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ABCC6O95255 1503 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC4A2P04920 1241 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 C8orf34Q49A92 452 aa21.81■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CACNA1FO60840 1977 aa21.8■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SMC5Q8IY18 1101 aa21.79■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CPDO75976 1380 aa21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 G2E3Q7L622 706 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.76■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CHRNA2Q15822 529 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 STK31Q9BXU1 1019 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.75■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa21.74■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TEFQ10587 303 aa21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.71■■□□□ 1.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms