RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 C6orf89Q6UWU4 347 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CAMK1DQ8IU85 385 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CADM3Q8N126 398 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 SLC35F6Q8N357 371 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 MMGT1Q8N4V1 131 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 MREGQ8N565 214 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 MCPH1Q8NEM0 835 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 RASSF8Q8NHQ8 419 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 METTL6Q8TCB7 284 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 UCMAQ8WVF2 138 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 WASF1Q92558 559 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 KLHL29Q96CT2 875 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 SAAL1Q96ER3 474 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 KLHL31Q9H511 634 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 HAUS4Q9H6D7 363 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 MYO6Q9UM54 1294 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 PXDNQ92626 1479 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 NUP188Q5SRE5 1749 aa5.17□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 STMND1H3BQB6 276 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 TAF4O00268 1085 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CHUKO15111 745 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CIAO1O76071 339 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CLDN7O95471 211 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 GYPCP04921 128 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 TMEM191BP0C7N4 346 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 SLC2A4P14672 509 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 TNFRSF1BP20333 461 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 MAP2K2P36507 400 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 RASSF2P50749 326 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 LINC00205P59089 165 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 SPAG1Q07617 926 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 TAF11Q15544 211 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 ALX1Q15699 326 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 MANEAQ5SRI9 462 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 ALS2CLQ60I27 953 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 ATG9BQ674R7 924 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 TMTC3Q6ZXV5 915 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 GPAT4Q86UL3 456 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CCDC148Q8NFR7 591 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CEP76Q8TAP6 659 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 NSMCE1Q8WV22 266 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 INPP5DQ92835 1189 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 CABS1Q96KC9 395 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 GSDMAQ96QA5 445 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 MVB12BQ9H7P6 319 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 BRF2Q9HAW0 419 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 FAM169AQ9Y6X4 670 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 AKAP11Q9UKA4 1901 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 RGPD2P0DJD1 1756 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 TNRQ92752 1358 aa5.16□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 KIF1AQ12756 1690 aa5.15□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 RREB1Q92766 1687 aa5.15□□□□□ -1.58
TRDN-204ENST00000542443 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 C5orf60A6NFR6 353 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 TGFB1I1O43294 461 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 CLEC3BP05452 202 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 IFNAR1P17181 557 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 CHRNB2P17787 502 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 POU1F1P28069 291 aa5.15□□□□□ -1.59
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TRDN-204ENST00000542443 AVPR1AP37288 418 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 RGS2P41220 211 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 TMPRSS3P57727 454 aa5.15□□□□□ -1.59
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TRDN-204ENST00000542443 SELENOVP59797 346 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 DCAF7P61962 342 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 PNOCQ13519 176 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 MTF1Q14872 753 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 DUSP6Q16828 381 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 KLHL22Q53GT1 634 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 TXNDC8Q6A555 127 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 EMBQ6PCB8 327 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 PARM1Q6UWI2 310 aa5.15□□□□□ -1.59
TRDN-204ENST00000542443 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.15□□□□□ -1.59
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