Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZM0

HEPHL1, Hephaestin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEPHL1Q6MZM0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.61
HEPHL1Q6MZM0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HEPHL1Q6MZM0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
HEPHL1Q6MZM0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HEPHL1Q6MZM0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HEPHL1Q6MZM0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
HEPHL1Q6MZM0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HEPHL1Q6MZM0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
HEPHL1Q6MZM0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HEPHL1Q6MZM0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
HEPHL1Q6MZM0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
HEPHL1Q6MZM0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HEPHL1Q6MZM0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HEPHL1Q6MZM0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HEPHL1Q6MZM0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HEPHL1Q6MZM0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HEPHL1Q6MZM0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HEPHL1Q6MZM0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HEPHL1Q6MZM0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HEPHL1Q6MZM0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HEPHL1Q6MZM0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HEPHL1Q6MZM0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HEPHL1Q6MZM0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HEPHL1Q6MZM0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HEPHL1Q6MZM0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HEPHL1Q6MZM0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HEPHL1Q6MZM0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HEPHL1Q6MZM0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HEPHL1Q6MZM0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HEPHL1Q6MZM0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HEPHL1Q6MZM0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HEPHL1Q6MZM0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HEPHL1Q6MZM0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HEPHL1Q6MZM0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HEPHL1Q6MZM0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HEPHL1Q6MZM0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HEPHL1Q6MZM0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HEPHL1Q6MZM0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HEPHL1Q6MZM0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HEPHL1Q6MZM0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HEPHL1Q6MZM0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HEPHL1Q6MZM0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HEPHL1Q6MZM0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HEPHL1Q6MZM0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HEPHL1Q6MZM0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HEPHL1Q6MZM0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
HEPHL1Q6MZM0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HEPHL1Q6MZM0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HEPHL1Q6MZM0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HEPHL1Q6MZM0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HEPHL1Q6MZM0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HEPHL1Q6MZM0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HEPHL1Q6MZM0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HEPHL1Q6MZM0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HEPHL1Q6MZM0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HEPHL1Q6MZM0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HEPHL1Q6MZM0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HEPHL1Q6MZM0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HEPHL1Q6MZM0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HEPHL1Q6MZM0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HEPHL1Q6MZM0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HEPHL1Q6MZM0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HEPHL1Q6MZM0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HEPHL1Q6MZM0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HEPHL1Q6MZM0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HEPHL1Q6MZM0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HEPHL1Q6MZM0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HEPHL1Q6MZM0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HEPHL1Q6MZM0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HEPHL1Q6MZM0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HEPHL1Q6MZM0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HEPHL1Q6MZM0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HEPHL1Q6MZM0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HEPHL1Q6MZM0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HEPHL1Q6MZM0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HEPHL1Q6MZM0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HEPHL1Q6MZM0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HEPHL1Q6MZM0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HEPHL1Q6MZM0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HEPHL1Q6MZM0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HEPHL1Q6MZM0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HEPHL1Q6MZM0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HEPHL1Q6MZM0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HEPHL1Q6MZM0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HEPHL1Q6MZM0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HEPHL1Q6MZM0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HEPHL1Q6MZM0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HEPHL1Q6MZM0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HEPHL1Q6MZM0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEPHL1Q6MZM0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HEPHL1Q6MZM0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HEPHL1Q6MZM0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HEPHL1Q6MZM0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HEPHL1Q6MZM0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HEPHL1Q6MZM0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HEPHL1Q6MZM0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HEPHL1Q6MZM0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEPHL1Q6MZM0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEPHL1Q6MZM0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEPHL1Q6MZM0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms