RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380135.7

LETMD1-202, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene LETMD1, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-202ENST00000380135 PTPRBP23467 1997 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CEP295Q9C0D2 2601 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CEP104O60308 925 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 OPA1O60313 960 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PPFIA2O75334 1257 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 FGGP02679 453 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CTBSQ01459 385 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 OLIG2Q13516 323 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 SNX1Q13596 522 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CCNG2Q16589 344 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PYCR3Q53H96 274 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 HES3Q5TGS1 186 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 KCTD11Q693B1 232 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 NRROSQ86YC3 692 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 GALNT13Q8IUC8 556 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 KYQ8NBH2 561 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 GATA6Q92908 595 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 GLYATL1Q969I3 302 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 DPEP2Q9H4A9 486 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 RMI1Q9H9A7 625 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ARNT2Q9HBZ2 717 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.143e-7■■□□□ 13.6
LETMD1-202ENST00000380135 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 JRKLQ9Y4A0 524 aa15.94■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 FAM149AA5PLN7 773 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 USP12O75317 370 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CXCR5P32302 372 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ACTN2P35609 894 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PEX6Q13608 980 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 SPARCL1Q14515 664 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 GPR156Q8NFN8 814 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 BRSK1Q8TDC3 778 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ABCG4Q9H172 646 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 TRIM39Q9HCM9 518 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 IL26Q9NPH9 171 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 C2orf81A6NN90 581 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 BUD23O43709 281 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 DNAJC6O75061 913 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 IFNB1P01574 187 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 AK4P27144 223 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 SPAM1P38567 509 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CLDN6P56747 220 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 LONRF2Q1L5Z9 754 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 MAPK15Q8TD08 544 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 VPS35Q96QK1 796 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ARFGAP3Q9NP61 516 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ATXN10Q9UBB4 475 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CLCA2Q9UQC9 943 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ST14Q9Y5Y6 855 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ARL5AQ9Y689 179 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 B4DGG1 531 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 NOBOXO60393 691 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CRTAMO95727 393 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 AP2A1O95782 977 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 MT-CO3P00414 261 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 C1QTNF9P0C862 333 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PDE1BQ01064 536 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 LRP8Q14114 963 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PERM1Q5SV97 790 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 SLC30A9Q6PML9 568 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 PBKQ96KB5 322 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 OR2AG1Q9H205 316 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 HOMER3Q9NSC5 361 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa15.92■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 TPRP12270 2363 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 ACACBO00763 2458 aa15.91■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 CHD8Q9HCK8 2581 aa15.91■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 KNTC1P50748 2209 aa15.91■□□□□ 0.14
LETMD1-202ENST00000380135 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms