RNA–Protein interactions for RNA: YML063W

RPS1B, Transcript of Ribosomal protein 10 (rp10) of the small (40S) subunit, yeast

Gene RPS1B, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS1B	YML063W	NUP82	P40368	713 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	CWH41	P53008	833 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	YGR122W	P53272	402 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	SPR28	Q04921	423 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	GPI13	Q07830	1017 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	PPM2	Q08282	695 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	NKP1	Q12493	238 aa		5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	PDR12	Q02785	1511 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	UBP1	P25037	809 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	PEP7	P32609	515 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	DAK2	P43550	591 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	ITC1	P53125	1264 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	CWC24	P53769	259 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	BDS1	Q08347	646 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	YLR125W	Q12138	136 aa		5.3	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	PHO8	P11491	566 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	CYC8	P14922	966 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	5.29	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	SAM37	P50110	327 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	HUL5	P53119	910 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	OXR1	Q08952	273 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	APC11	Q12157	165 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	SEC6	P32844	805 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	SOH1	P38633	127 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	YBT1	P32386	1661 aa		5.28	□□□□□ -1.56
RPS1B	YML063W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	RAD2	P07276	1031 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	GAL11	P19659	1081 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	CIC1	P38779	376 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	ERP2	P39704	215 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	YEN1	P40028	759 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	PDR10	P51533	1564 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	CDC55	Q00362	526 aa		5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	YOR093C	Q12275	1648 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	SRM1	P21827	482 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	ISU1	Q03020	165 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	ATG20	Q07528	640 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	5.26	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	SUV3	P32580	737 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	VTC4	P47075	721 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	MTO1	P53070	669 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	YNL011C	P53980	444 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	DNM1	P54861	757 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	MTC5	Q03897	1148 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	DPH6	Q12429	685 aa		5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	RAD4	P14736	754 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	TOA1	P32773	286 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	GDE1	Q02979	1223 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	MCD1	Q12158	566 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	IQG1	Q12280	1495 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	ATP4	P05626	244 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	CDC34	P14682	295 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	RAD27	P26793	382 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	YBR197C	P38306	217 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	YGR053C	P53234	283 aa		5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.23	□□□□□ -1.57	not detected
RPS1B	YML063W	STH1	P32597	1359 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	THI4	P32318	326 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	FUI1	P38196	639 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	MRPS18	P42847	217 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	TIM54	P47045	478 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	JJJ3	P47138	172 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	LYS5	P50113	272 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	PEX8	P53248	589 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	RSC4	Q02206	625 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	COG4	Q06096	861 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	OPI10	Q08202	246 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	BUD3	P25558	1636 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	TRM3	Q07527	1436 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RPS1B	YML063W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
RPS1B	YML063W	CYT1	P07143	309 aa		5.21	□□□□□ -1.58
RPS1B	YML063W	DAL1	P32375	460 aa		5.21	□□□□□ -1.58

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.5 ms