RNA–Protein interactions for RNA: YKR082W

NUP133, Transcript of Subunit of Nup84p subcomplex of nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NUP133, Length 3,474 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUP133	YKR082W	SSH4	P32343	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	NUP120	P35729	1037 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YKL222C	P35995	705 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	NDE1	P40215	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SAP185	P40856	1058 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	PMT7	Q06644	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	PCL8	Q08966	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	NFI1	Q12216	726 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TAF5	P38129	798 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	RAD26	P40352	1085 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	PHO87	P25360	923 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	CCL1	P37366	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SGM1	P47166	707 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SPC19	Q03954	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MDM38	Q08179	573 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	DAL1	P32375	460 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	BNA1	P47096	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	CSN12	P47130	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	FDC1	Q03034	503 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SDH5	Q08230	162 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	ALR1	Q08269	859 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	HIR1	P32479	840 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	KDX1	P36005	433 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	PEX18	P38855	283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	GTT3	P39996	337 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	TAP42	Q04372	366 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	DNF1	P32660	1571 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	PDR10	P51533	1564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	JIP3	O13555	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	VTC2	P43585	828 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	JJJ1	P53863	590 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	FAP1	P53971	965 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MRX10	Q05648	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	SWA2	Q06677	668 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	MED1	Q12321	566 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	YVC1	Q12324	675 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	RKM4	Q12504	494 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUP133	YKR082W	CLN1	P20437	546 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	YML6	P51998	286 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	ALF1	P53904	254 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	CIT1	P00890	479 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	PGS1	P25578	521 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	TPD3	P31383	635 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	NUP82	P40368	713 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	VTC4	P47075	721 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	HUL5	P53119	910 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	RMD1	Q03441	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	TFB4	Q12004	338 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	MGE1	P38523	228 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	ARP9	Q05123	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	PSR2	Q07949	397 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	CSE4	P36012	229 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	TGL4	P36165	910 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	FMP10	P40098	244 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	GUT1	P32190	709 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	MET4	P32389	672 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	CNS1	P33313	385 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	MER1	P16523	270 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	MSH2	P25847	964 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	DLD1	P32891	587 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	YIL166C	P40445	542 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	DAS1	P47005	663 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	AAD16	Q02895	342 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NUP133	YKR082W	REH1	Q06709	432 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 32.8 ms