RNA–Protein interactions for RNA: YHR029C

YHI9, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YHI9, Length 885 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHI9	YHR029C	TY4A-J	P47023	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
YHI9	YHR029C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	NUP82	P40368	713 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	HUL5	P53119	910 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	YNR040W	P53736	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	RMD1	Q03441	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	CAB1	Q04430	367 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	RPC31	P17890	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	SEC6	P32844	805 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	MNN4	P36044	1178 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	APC11	Q12157	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	SRM1	P21827	482 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
YHI9	YHR029C	PET112	P33893	541 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	UFD2	P54860	961 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	GIS4	Q04233	774 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	GAS5	Q08193	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	PHO8	P11491	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	VMA3	P25515	160 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	KTR2	P33550	425 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	DAK2	P43550	591 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	FOL1	P53848	824 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	DNM1	P54861	757 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHI9	YHR029C	MRPL33	P20084	86 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	MNR2	P35724	969 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	DYS1	P38791	387 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	AVT1	P47082	602 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	RAD4	P14736	754 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	IDI1	P15496	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	THI4	P32318	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	TIM23	P32897	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	TIM54	P47045	478 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	ITC1	P53125	1264 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	PRI2	P20457	528 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	RAD27	P26793	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	LDH1	P38139	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	RRM3	P38766	723 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	COG4	Q06096	861 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	OXR1	Q08952	273 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	MRP10	O75012	95 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	AI3	P03877	415 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	MRC1	P25588	1096 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	FUI1	P38196	639 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	GIP1	P38229	639 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	BSD2	P38356	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	CDC55	Q00362	526 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	ENT2	Q05785	613 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	NKP1	Q12493	238 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	CYC8	P14922	966 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	SAC7	P17121	654 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	DPB3	P27344	201 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	VPS35	P34110	944 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	TAT2	P38967	592 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	SAM37	P50110	327 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	YNL011C	P53980	444 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	TOS4	Q06266	489 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	ADR1	P07248	1323 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	RAD2	P07276	1031 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	ISW1	P38144	1129 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	YHL008C	P38750	627 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	DAS1	P47005	663 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	YGR122W	P53272	402 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	SPO20	Q04359	397 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	PPM2	Q08282	695 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YHI9	YHR029C	TRP3	P00937	484 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHI9	YHR029C	TOA1	P32773	286 aa		4.77	□□□□□ -1.65

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