RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641667.1

AP006294.2-201, humanhuman

BASIC

Gene AP006294.2, Length 209 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP006294.2-201ENST00000641667 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.34■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 EXOC5O00471 708 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.33■■■□□ 2.13
AP006294.2-201ENST00000641667 BCL9O00512 1426 aa28.32■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.31■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 PEAK1Q9H792 1746 aa28.3■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.3■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 LRRC37A3O60309 1634 aa28.29■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 STK32BQ9NY57 414 aa28.27■■■□□ 2.12
AP006294.2-201ENST00000641667 CCDC7Q96M83 1385 aa28.25■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 SBF2Q86WG5 1849 aa28.25■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 SOX12O15370 315 aa28.25■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 PIK3C2AO00443 1686 aa28.25■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 COL18A1P39060 1754 aa28.24■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.24■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 TXNRD1Q16881 649 aa28.23■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 PROM2Q8N271 834 aa28.23■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
AP006294.2-201ENST00000641667 PTF1AQ7RTS3 328 aa28.2■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 AKAP12Q02952 1782 aa28.19■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 ZBTB7AO95365 584 aa28.19■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 SLC15A2Q16348 729 aa28.19■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 ABCC6O95255 1503 aa28.17■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.16■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 MTFR1LQ9H019 292 aa28.16■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 NEUROD1Q13562 356 aa28.14■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.14■■■□□ 2.1
AP006294.2-201ENST00000641667 CASZ1Q86V15 1759 aa28.14■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 PTGER2P43116 358 aa28.13■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 IL2RBP14784 551 aa28.12■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.12■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 TNS2Q63HR2 1409 aa28.11■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.11■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 RGPD5Q99666 1765 aa28.11■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 USP31Q70CQ4 1352 aa28.11■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 NFAT5O94916 1531 aa28.1■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 ERBB3P21860 1342 aa28.09■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 TMC1Q8TDI8 760 aa28.08■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 SYT17Q9BSW7 474 aa28.08■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.08■■■□□ 2.09
AP006294.2-201ENST00000641667 ACSBG1Q96GR2 724 aa28.07■■■□□ 2.08
AP006294.2-201ENST00000641667 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
AP006294.2-201ENST00000641667 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.06■■■□□ 2.08
AP006294.2-201ENST00000641667 NME9Q86XW9 330 aa28.03■■■□□ 2.08
AP006294.2-201ENST00000641667 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.03■■■□□ 2.08
AP006294.2-201ENST00000641667 ARXQ96QS3 562 aa28.03■■■□□ 2.08
AP006294.2-201ENST00000641667 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.03■■■□□ 2.08
AP006294.2-201ENST00000641667 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.01■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 MYOM1P52179 1685 aa28■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 NHSQ6T4R5 1651 aa28■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.99■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 SLC24A1O60721 1099 aa27.98■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 SLC27A3Q5K4L6 730 aa27.98■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 SLC16A10Q8TF71 515 aa27.98■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.97■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 USP54Q70EL1 1684 aa27.95■■■□□ 2.07
AP006294.2-201ENST00000641667 IP6K1Q92551 441 aa27.95■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 POLD1P28340 1107 aa27.94■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 MAP3K5Q99683 1374 aa27.94■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 LTN1O94822 1766 aa27.92■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.92■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 GPR162Q16538 588 aa27.9■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 COG3Q96JB2 828 aa27.89■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.89■■■□□ 2.06
AP006294.2-201ENST00000641667 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.88■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 BTAF1O14981 1849 aa27.88■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 ZNF827Q17R98 1081 aa27.88■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.88■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 AKT1S1Q96B36 256 aa27.87■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 A0A1W2PP64 1363 aa27.86■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 PAPPAQ13219 1627 aa27.86■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 AMPHP49418 695 aa27.86■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 UTRNP46939 3433 aa27.86■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 CHD4Q14839 1912 aa27.84■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 TONSLQ96HA7 1378 aa27.84■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
AP006294.2-201ENST00000641667 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
AP006294.2-201ENST00000641667 KLHL34Q8N239 644 aa27.82■■■□□ 2.04
AP006294.2-201ENST00000641667 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
AP006294.2-201ENST00000641667 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.82■■■□□ 2.04
AP006294.2-201ENST00000641667 HOXC9P31274 260 aa27.8■■■□□ 2.04
AP006294.2-201ENST00000641667 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms