RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 EVC2Q86UK5 1308 aa39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 AXIN2Q9Y2T1 843 aa39.4■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 PTF1AQ7RTS3 328 aa39.39■■■■□ 3.9
CAPNS1-217ENST00000629983 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP39.38■■■■□ 3.89
CAPNS1-217ENST00000629983 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP39.37■■■■□ 3.89
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNH5Q8NCM2 988 aa39.34■■■■□ 3.89
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3C2AO00443 1686 aa39.34■■■■□ 3.89
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa39.33■■■■□ 3.89
CAPNS1-217ENST00000629983 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
CAPNS1-217ENST00000629983 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa39.32■■■■□ 3.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF25Q86VW2 580 aa39.32■■■■□ 3.89
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB7AO95365 584 aa39.3■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 CARD10Q9BWT7 1032 aa39.29■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 COL18A1P39060 1754 aa39.28■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 STK32BQ9NY57 414 aa39.27■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 SBF2Q86WG5 1849 aa39.26■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 EXOC5O00471 708 aa39.26■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 PROM2Q8N271 834 aa39.26■■■■□ 3.88
CAPNS1-217ENST00000629983 BCL9O00512 1426 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC21AQ8NDW8 1320 aa39.24■■■■□ 3.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa39.23■■■■□ 3.87
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNRD1Q16881 649 aa39.23■■■■□ 3.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP39.23■■■■□ 3.87
CAPNS1-217ENST00000629983 WNK3Q9BYP7 1800 aa39.23■■■■□ 3.87
CAPNS1-217ENST00000629983 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CASZ1Q86V15 1759 aa39.21■■■■□ 3.87
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC7Q96M83 1385 aa39.2■■■■□ 3.87
CAPNS1-217ENST00000629983 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP12Q02952 1782 aa39.18■■■■□ 3.86
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC15A2Q16348 729 aa39.16■■■■□ 3.86
CAPNS1-217ENST00000629983 TNS2Q63HR2 1409 aa39.14■■■■□ 3.86
CAPNS1-217ENST00000629983 NFAT5O94916 1531 aa39.14■■■■□ 3.86
CAPNS1-217ENST00000629983 PTGER2P43116 358 aa39.13■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP39.12■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSBG1Q96GR2 724 aa39.12■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 NLRP2Q9NX02 1062 aa39.11■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MYOM1P52179 1685 aa39.1■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 NEUROD1Q13562 356 aa39.1■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 SIN3AQ96ST3 1273 aa39.1■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 RGPD5Q99666 1765 aa39.1■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP39.07■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 MTFR1LQ9H019 292 aa39.07■■■■□ 3.85
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCC6O95255 1503 aa39.05■■■■□ 3.84
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT17Q9BSW7 474 aa39.03■■■■□ 3.84
CAPNS1-217ENST00000629983 ERBB3P21860 1342 aa39.03■■■■□ 3.84
CAPNS1-217ENST00000629983 IL2RBP14784 551 aa39.01■■■■□ 3.84
CAPNS1-217ENST00000629983 NME9Q86XW9 330 aa39.01■■■■□ 3.84
CAPNS1-217ENST00000629983 TMC1Q8TDI8 760 aa39■■■■□ 3.83
CAPNS1-217ENST00000629983 USP31Q70CQ4 1352 aa38.98■■■■□ 3.83
CAPNS1-217ENST00000629983 NHSQ6T4R5 1651 aa38.97■■■■□ 3.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD24Q8TF21 1146 aa38.97■■■■□ 3.83
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP38.96■■■■□ 3.83
CAPNS1-217ENST00000629983 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
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CAPNS1-217ENST00000629983 SGIP1Q9BQI5 828 aa38.93■■■■□ 3.82
CAPNS1-217ENST00000629983 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa38.91■■■■□ 3.82
CAPNS1-217ENST00000629983 CARD11Q9BXL7 1154 aa38.89■■■■□ 3.82
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF827Q17R98 1081 aa38.88■■■■□ 3.81
CAPNS1-217ENST00000629983 CD163L1Q9NR16 1453 aa38.86■■■■□ 3.81
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa38.85■■■■□ 3.81
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL34Q8N239 644 aa38.84■■■■□ 3.81
CAPNS1-217ENST00000629983 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP38.84■■■■□ 3.81
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPPAQ13219 1627 aa38.84■■■■□ 3.81
CAPNS1-217ENST00000629983 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
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CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC4BQ9NT99 713 aa38.83■■■■□ 3.81
CAPNS1-217ENST00000629983 TERF2IPQ9NYB0 399 aa38.83■■■■□ 3.81
CAPNS1-217ENST00000629983 USP54Q70EL1 1684 aa38.81■■■■□ 3.8
CAPNS1-217ENST00000629983 LTN1O94822 1766 aa38.8■■■■□ 3.8
CAPNS1-217ENST00000629983 BTAF1O14981 1849 aa38.8■■■■□ 3.8
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR162Q16538 588 aa38.78■■■■□ 3.8
CAPNS1-217ENST00000629983 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K5Q99683 1374 aa38.77■■■■□ 3.8
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PP64 1363 aa38.76■■■■□ 3.8
CAPNS1-217ENST00000629983 POLD1P28340 1107 aa38.75■■■■□ 3.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC27A3Q5K4L6 730 aa38.75■■■■□ 3.79
CAPNS1-217ENST00000629983 IP6K1Q92551 441 aa38.75■■■■□ 3.79
CAPNS1-217ENST00000629983 AKT1S1Q96B36 256 aa38.74■■■■□ 3.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa38.71■■■■□ 3.79
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CAPNS1-217ENST00000629983 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa38.71■■■■□ 3.79
CAPNS1-217ENST00000629983 KAT6BQ8WYB5 2073 aa38.69■■■■□ 3.78
CAPNS1-217ENST00000629983 UTRNP46939 3433 aa38.68■■■■□ 3.78
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNQ4P56696 695 aa38.68■■■■□ 3.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa38.67■■■■□ 3.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP38.67■■■■□ 3.78
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CAPNS1-217ENST00000629983 AMPHP49418 695 aa38.65■■■■□ 3.78
CAPNS1-217ENST00000629983 C1QTNF8P60827 252 aa38.64■■■■□ 3.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa38.62■■■■□ 3.77
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP3K19Q56UN5 1328 aa38.62■■■■□ 3.77
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXC9P31274 260 aa38.61■■■■□ 3.77
CAPNS1-217ENST00000629983 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
CAPNS1-217ENST00000629983 TONSLQ96HA7 1378 aa38.6■■■■□ 3.77
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