RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.39■■■■□ 3.1
CAPNS1-216ENST00000628306 PLSCR1O15162 318 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP12Q02952 1782 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 DDB1Q16531 1140 aa34.37■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL9O00512 1426 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 EVC2Q86UK5 1308 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 RGPD5Q99666 1765 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 PROM2Q8N271 834 aa34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 NFAT5O94916 1531 aa34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 CASZ1Q86V15 1759 aa34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNQ2O43526 872 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 SPON1Q9HCB6 807 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-216ENST00000628306 SIN3AQ96ST3 1273 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-216ENST00000628306 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-216ENST00000628306 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.26■■■■□ 3.08
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-216ENST00000628306 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX12O15370 315 aa34.23■■■■□ 3.07
CAPNS1-216ENST00000628306 MON2Q7Z3U7 1717 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC6O95255 1503 aa34.22■■■■□ 3.07
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP34.2■■■■□ 3.07
CAPNS1-216ENST00000628306 USP54Q70EL1 1684 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 YY1P25490 414 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.19■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 UTRNP46939 3433 aa34.18■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TNS2Q63HR2 1409 aa34.17■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 USP31Q70CQ4 1352 aa34.16■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC7Q96M83 1385 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 TXNRD1Q16881 649 aa34.15■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGER2P43116 358 aa34.14■■■■□ 3.06
CAPNS1-216ENST00000628306 EXOC5O00471 708 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-216ENST00000628306 MYOM1P52179 1685 aa34.12■■■■□ 3.05
CAPNS1-216ENST00000628306 NHSQ6T4R5 1651 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB7AO95365 584 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-216ENST00000628306 NEUROD1Q13562 356 aa34.11■■■■□ 3.05
CAPNS1-216ENST00000628306 ERBB3P21860 1342 aa34.09■■■■□ 3.05
CAPNS1-216ENST00000628306 NME9Q86XW9 330 aa34.08■■■■□ 3.05
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC15A2Q16348 729 aa34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP34.07■■■■□ 3.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PAPPAQ13219 1627 aa34.06■■■■□ 3.04
CAPNS1-216ENST00000628306 LTN1O94822 1766 aa34.05■■■■□ 3.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SGIP1Q9BQI5 828 aa34.04■■■■□ 3.04
CAPNS1-216ENST00000628306 STK32BQ9NY57 414 aa34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSBG1Q96GR2 724 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.99■■■■□ 3.03
CAPNS1-216ENST00000628306 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.98■■■■□ 3.03
CAPNS1-216ENST00000628306 BTAF1O14981 1849 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-216ENST00000628306 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-216ENST00000628306 IL2RBP14784 551 aa33.97■■■■□ 3.03
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.96■■■■□ 3.03
CAPNS1-216ENST00000628306 MTFR1LQ9H019 292 aa33.95■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 DCAF8L1A6NGE4 600 aa33.94■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 CARD11Q9BXL7 1154 aa33.94■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PP64 1363 aa33.94■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 SYT17Q9BSW7 474 aa33.93■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF827Q17R98 1081 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 TMC1Q8TDI8 760 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.91■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
CAPNS1-216ENST00000628306 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
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CAPNS1-216ENST00000628306 TERF2IPQ9NYB0 399 aa33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP33.82■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 AKT1S1Q96B36 256 aa33.82■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 TESK2Q96S53 571 aa33.82■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K5Q99683 1374 aa33.82■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 KAT6BQ8WYB5 2073 aa33.81■■■■□ 3
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CAPNS1-216ENST00000628306 TONSLQ96HA7 1378 aa33.8■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 ARXQ96QS3 562 aa33.8■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 COL24A1Q17RW2 1714 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 QSER1Q2KHR3 1735 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 SHANK3Q9BYB0 1731 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 FBLN1P23142 703 aa33.76■■■■□ 3
CAPNS1-216ENST00000628306 NSD2O96028 1365 aa33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K19Q56UN5 1328 aa33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-216ENST00000628306 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
CAPNS1-216ENST00000628306 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-216ENST00000628306 RGPD2P0DJD1 1756 aa33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD4Q14839 1912 aa33.73■■■□□ 2.99
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