RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 UTRNP46939 3433 aa26.33■■□□□ 1.81
UBE2C-208ENST00000617055 COL18A1P39060 1754 aa26.33■■□□□ 1.81
UBE2C-208ENST00000617055 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.33■■□□□ 1.81
UBE2C-208ENST00000617055 USP6P35125 1406 aa26.32■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 MYOM1P52179 1685 aa26.32■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 ZBTB7AO95365 584 aa26.31■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 PROM2Q8N271 834 aa26.31■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 BCL9O00512 1426 aa26.31■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 WDR17Q8IZU2 1322 aa26.3■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 PIK3C2AO00443 1686 aa26.29■■□□□ 1.8
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UBE2C-208ENST00000617055 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 CABP1Q9NZU7 370 aa26.29■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 PTGER2P43116 358 aa26.28■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 AXIN2Q9Y2T1 843 aa26.28■■□□□ 1.8
UBE2C-208ENST00000617055 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
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UBE2C-208ENST00000617055 STK32BQ9NY57 414 aa26.25■■□□□ 1.79
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UBE2C-208ENST00000617055 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
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UBE2C-208ENST00000617055 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2C-208ENST00000617055 SLC15A2Q16348 729 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2C-208ENST00000617055 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.21■■□□□ 1.79
UBE2C-208ENST00000617055 CHD4Q14839 1912 aa26.2■■□□□ 1.79
UBE2C-208ENST00000617055 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
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UBE2C-208ENST00000617055 MTFR1LQ9H019 292 aa26.18■■□□□ 1.78
UBE2C-208ENST00000617055 SOX12O15370 315 aa26.16■■□□□ 1.78
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UBE2C-208ENST00000617055 NHSQ6T4R5 1651 aa26.15■■□□□ 1.78
UBE2C-208ENST00000617055 EVC2Q86UK5 1308 aa26.14■■□□□ 1.78
UBE2C-208ENST00000617055 TNS2Q63HR2 1409 aa26.14■■□□□ 1.78
UBE2C-208ENST00000617055 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.14■■□□□ 1.78
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC7Q96M83 1385 aa26.14■■□□□ 1.78
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
UBE2C-208ENST00000617055 NFAT5O94916 1531 aa26.13■■□□□ 1.77
UBE2C-208ENST00000617055 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.11■■□□□ 1.77
UBE2C-208ENST00000617055 ABCC6O95255 1503 aa26.1■■□□□ 1.77
UBE2C-208ENST00000617055 ARXQ96QS3 562 aa26.09■■□□□ 1.77
UBE2C-208ENST00000617055 PAPPAQ13219 1627 aa26.09■■□□□ 1.77
UBE2C-208ENST00000617055 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.08■■□□□ 1.77
UBE2C-208ENST00000617055 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.08■■□□□ 1.77
UBE2C-208ENST00000617055 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.06■■□□□ 1.76
UBE2C-208ENST00000617055 BTAF1O14981 1849 aa26.06■■□□□ 1.76
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UBE2C-208ENST00000617055 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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UBE2C-208ENST00000617055 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.98■■□□□ 1.75
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UBE2C-208ENST00000617055 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2C-208ENST00000617055 USP31Q70CQ4 1352 aa25.96■■□□□ 1.75
UBE2C-208ENST00000617055 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
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UBE2C-208ENST00000617055 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
UBE2C-208ENST00000617055 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2C-208ENST00000617055 AKT1S1Q96B36 256 aa25.93■■□□□ 1.74
UBE2C-208ENST00000617055 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2C-208ENST00000617055 NME9Q86XW9 330 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2C-208ENST00000617055 KLHL34Q8N239 644 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2C-208ENST00000617055 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.92■■□□□ 1.74
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UBE2C-208ENST00000617055 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2C-208ENST00000617055 CEP350Q5VT06 3117 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2C-208ENST00000617055 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
UBE2C-208ENST00000617055 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.89■■□□□ 1.74
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UBE2C-208ENST00000617055 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2C-208ENST00000617055 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
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UBE2C-208ENST00000617055 KCNQ4P56696 695 aa25.82■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 TMC1Q8TDI8 760 aa25.82■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 LY75O60449 1722 aa25.81■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.81■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.81■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 IP6K1Q92551 441 aa25.79■■□□□ 1.72
UBE2C-208ENST00000617055 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.79■■□□□ 1.72
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