RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 FMN1Q68DA7 1419 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.86■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 ZWINTO95229 277 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF76P36508 570 aa21.86■■□□□ 1.09
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PTPRJ-207ENST00000613246 COMMD10Q9Y6G5 202 aa21.86■■□□□ 1.09
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PTPRJ-207ENST00000613246 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.85■■□□□ 1.09
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PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 PANK1Q8TE04 598 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 RUNDC1Q96C34 613 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 TMCO5BA8MYB1 307 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PTPRJ-207ENST00000613246 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.83■■□□□ 1.09
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PTPRJ-207ENST00000613246 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 KRT85P78386 507 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.81■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 RAI14Q9P0K7 980 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 GNAI1P63096 354 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 MICALCLQ6ZW33 695 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 CUX2O14529 1486 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 MCM3P25205 808 aa21.8■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SPA17Q15506 151 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 HOMER2Q9NSB8 354 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRJ-207ENST00000613246 SMTNL1A8MU46 457 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRJ-207ENST00000613246 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
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PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP100Q494V2 611 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRJ-207ENST00000613246 FERP16591 822 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 CHMP4BP1P59074 171 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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PTPRJ-207ENST00000613246 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.76■■□□□ 1.07
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PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC30Q5VVM6 783 aa21.76■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF428Q96B54 188 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 KIF5CO60282 957 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 TIGD1Q96MW7 591 aa21.75■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 CTNNA2P26232 953 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 DNA2P51530 1060 aa21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 SPECC1Q5M775 1068 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRJ-207ENST00000613246 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP21.74■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 USP47Q96K76 1375 aa21.74■■□□□ 1.07
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PTPRJ-207ENST00000613246 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC160A6NGH7 325 aa21.73■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM107BQ9H098 131 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 TNNT1P13805 278 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 PTPN14Q15678 1187 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.72■■□□□ 1.07
PTPRJ-207ENST00000613246 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.72■■□□□ 1.07
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