RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575237.2

CREBBP-211, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene CREBBP, Length 403 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-211ENST00000575237 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.53■□□□□ 0.88
CREBBP-211ENST00000575237 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa20.52■□□□□ 0.88
CREBBP-211ENST00000575237 STK32BQ9NY57 414 aa20.52■□□□□ 0.88
CREBBP-211ENST00000575237 SLIT3O75094 1523 aa20.52■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.52■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 SLC15A2Q16348 729 aa20.51■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 TXNRD1Q16881 649 aa20.51■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.51■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.5■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 C1QTNF8P60827 252 aa20.5■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 MTFR1LQ9H019 292 aa20.5■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 WDR17Q8IZU2 1322 aa20.5■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.49■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 NLRP6P59044 892 aa20.49■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 COL18A1P39060 1754 aa20.49■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 CHD4Q14839 1912 aa20.49■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 WNK3Q9BYP7 1800 aa20.48■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.48■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 CEP350Q5VT06 3117 aa20.47■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 USP6P35125 1406 aa20.47■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 AKAP12Q02952 1782 aa20.46■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 MAP3K5Q99683 1374 aa20.46■□□□□ 0.87
CREBBP-211ENST00000575237 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.44■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.44■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 CABP2Q9NPB3 220 aa20.44■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 CABP1Q9NZU7 370 aa20.43■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.42■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 ARXQ96QS3 562 aa20.42■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 EXOC5O00471 708 aa20.41■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.41■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 PIK3C2AO00443 1686 aa20.41■□□□□ 0.86
CREBBP-211ENST00000575237 IFFO2Q5TF58 517 aa20.39■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 TNS2Q63HR2 1409 aa20.38■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 PAPPAQ13219 1627 aa20.38■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 CCDC7Q96M83 1385 aa20.37■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.37■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.37■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 NHSQ6T4R5 1651 aa20.36■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.36■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.35■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 RGPD5Q99666 1765 aa20.34■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 GPR162Q16538 588 aa20.34■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 NFAT5O94916 1531 aa20.33■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 ABCC6O95255 1503 aa20.33■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.33■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF827Q17R98 1081 aa20.33■□□□□ 0.85
CREBBP-211ENST00000575237 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.32■□□□□ 0.84
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CREBBP-211ENST00000575237 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.3■□□□□ 0.84
CREBBP-211ENST00000575237 SOX12O15370 315 aa20.3■□□□□ 0.84
CREBBP-211ENST00000575237 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.29■□□□□ 0.84
CREBBP-211ENST00000575237 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.29■□□□□ 0.84
CREBBP-211ENST00000575237 EVC2Q86UK5 1308 aa20.28■□□□□ 0.84
CREBBP-211ENST00000575237 BTAF1O14981 1849 aa20.27■□□□□ 0.84
CREBBP-211ENST00000575237 AKT1S1Q96B36 256 aa20.27■□□□□ 0.84
CREBBP-211ENST00000575237 COL24A1Q17RW2 1714 aa20.26■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 ERBB3P21860 1342 aa20.26■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 SHANK3Q9BYB0 1731 aa20.25■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 IL2RBP14784 551 aa20.25■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 POLD1P28340 1107 aa20.25■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.24■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.23■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.23■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 KLHL34Q8N239 644 aa20.22■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa20.22■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.21■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.21■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 USP31Q70CQ4 1352 aa20.21■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CREBBP-211ENST00000575237 GRIN3BO60391 1043 aa20.18■□□□□ 0.82
CREBBP-211ENST00000575237 USP54Q70EL1 1684 aa20.18■□□□□ 0.82
CREBBP-211ENST00000575237 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
CREBBP-211ENST00000575237 ANKRD24Q8TF21 1146 aa20.17■□□□□ 0.82
CREBBP-211ENST00000575237 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa20.17■□□□□ 0.82
CREBBP-211ENST00000575237 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.15■□□□□ 0.82
CREBBP-211ENST00000575237 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.15■□□□□ 0.82
CREBBP-211ENST00000575237 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 ATP10DQ9P241 1426 aa20.12■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.12■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 KCNQ4P56696 695 aa20.12■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 NME9Q86XW9 330 aa20.12■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 LTN1O94822 1766 aa20.12■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa20.1■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.1■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.1■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 NSD2O96028 1365 aa20.09■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 LY75O60449 1722 aa20.09■□□□□ 0.81
CREBBP-211ENST00000575237 HSPA6P17066 643 aa20.07■□□□□ 0.8
CREBBP-211ENST00000575237 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
CREBBP-211ENST00000575237 IP6K1Q92551 441 aa20.07■□□□□ 0.8
CREBBP-211ENST00000575237 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 143.1 ms