RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570016.5

CDIPT-210, Transcript of CDP-diacylglycerol--inositol 3-phosphatidyltransferase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CDIPT, Length 1,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDIPT-210ENST00000570016 MYT1Q01538 1121 aa30.41■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 CDCA8Q53HL2 280 aa30.41■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 CRB1P82279 1406 aa30.4■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.4■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 TCP11L2Q8N4U5 519 aa30.39■■■□□ 2.46
CDIPT-210ENST00000570016 USP35Q9P2H5 1018 aa30.35■■■□□ 2.45
CDIPT-210ENST00000570016 WDR17Q8IZU2 1322 aa30.34■■■□□ 2.45
CDIPT-210ENST00000570016 ZBTB7CA1YPR0 619 aa30.34■■■□□ 2.45
CDIPT-210ENST00000570016 SOX12O15370 315 aa30.33■■■□□ 2.45
CDIPT-210ENST00000570016 RGPD5Q99666 1765 aa30.31■■■□□ 2.44
CDIPT-210ENST00000570016 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CDIPT-210ENST00000570016 MYOM1P52179 1685 aa30.29■■■□□ 2.44
CDIPT-210ENST00000570016 LTN1O94822 1766 aa30.27■■■□□ 2.44
CDIPT-210ENST00000570016 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa30.27■■■□□ 2.44
CDIPT-210ENST00000570016 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP30.26■■■□□ 2.44
CDIPT-210ENST00000570016 CARD10Q9BWT7 1032 aa30.26■■■□□ 2.44
CDIPT-210ENST00000570016 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 FAM182BQ5T319 152 aa30.24■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 COG3Q96JB2 828 aa30.24■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 RGPD1P0DJD0 1748 aa30.23■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 FAM196AQ6ZSG2 479 aa30.23■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 ERBB3P21860 1342 aa30.23■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 WNK3Q9BYP7 1800 aa30.23■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 FYB1O15117 783 aa30.22■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 PDE3BQ13370 1112 aa30.22■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 DEFB132Q7Z7B7 95 aa30.22■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 DISP2A7MBM2 1401 aa30.21■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 CCDC7Q96M83 1385 aa30.2■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 LRRC37A3O60309 1634 aa30.2■■■□□ 2.43
CDIPT-210ENST00000570016 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa30.19■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 CARD14Q9BXL6 1004 aa30.19■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 IP6K1Q92551 441 aa30.18■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 BAG6P46379 1132 aa30.17■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 PEAK1Q9H792 1746 aa30.16■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 MAP3K19Q56UN5 1328 aa30.15■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 KIF20BQ96Q89 1820 aa30.14■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 DDB1Q16531 1140 aa30.14■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 GGNBP2Q9H3C7 697 aa30.14■■■□□ 2.42
CDIPT-210ENST00000570016 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.13■■■□□ 2.41
CDIPT-210ENST00000570016 NSD3Q9BZ95 1437 aa30.13■■■□□ 2.41
CDIPT-210ENST00000570016 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa30.12■■■□□ 2.41
CDIPT-210ENST00000570016 BCL9O00512 1426 aa30.12■■■□□ 2.41
CDIPT-210ENST00000570016 RTL1A6NKG5 1358 aa30.11■■■□□ 2.41
CDIPT-210ENST00000570016 TRIM37O94972 964 aa30.1■■■□□ 2.41
CDIPT-210ENST00000570016 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
CDIPT-210ENST00000570016 FBLN1P23142 703 aa30.09■■■□□ 2.41
CDIPT-210ENST00000570016 HOXC9P31274 260 aa30.09■■■□□ 2.41
CDIPT-210ENST00000570016 NLRP2Q9NX02 1062 aa30.07■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 TNS2Q63HR2 1409 aa30.06■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 KIF24Q5T7B8 1368 aa30.05■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 PARD3Q8TEW0 1356 aa30.04■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 AMPHP49418 695 aa30.04■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 EXOC5O00471 708 aa30.03■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 CAMKK2Q96RR4 588 aa30.03■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.03■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 SBF2Q86WG5 1849 aa30.02■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 IL2RBP14784 551 aa30.01■■■□□ 2.4
CDIPT-210ENST00000570016 APBA3O96018 575 aa30■■■□□ 2.39
CDIPT-210ENST00000570016 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
CDIPT-210ENST00000570016 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.98■■■□□ 2.39
CDIPT-210ENST00000570016 INSRP06213 1382 aa29.97■■■□□ 2.39
CDIPT-210ENST00000570016 FLT4P35916 1363 aa29.97■■■□□ 2.39
CDIPT-210ENST00000570016 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
CDIPT-210ENST00000570016 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa29.96■■■□□ 2.39
CDIPT-210ENST00000570016 RREB1Q92766 1687 aa29.95■■■□□ 2.39
CDIPT-210ENST00000570016 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa29.95■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 PANK3Q9H999 370 aa29.95■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.94■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 PLSCR1O15162 318 aa29.93■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.92■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa29.92■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 NSD2O96028 1365 aa29.9■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa29.9■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.89■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 NBPF6Q5VWK0 638 aa29.89■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 NBPF4Q96M43 638 aa29.89■■■□□ 2.38
CDIPT-210ENST00000570016 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.88■■■□□ 2.37
CDIPT-210ENST00000570016 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.87■■■□□ 2.37
CDIPT-210ENST00000570016 WASHC2AQ641Q2 1341 aa29.86■■■□□ 2.37
CDIPT-210ENST00000570016 MEGF6O75095 1541 aa29.86■■■□□ 2.37
CDIPT-210ENST00000570016 NHSQ6T4R5 1651 aa29.86■■■□□ 2.37
CDIPT-210ENST00000570016 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
CDIPT-210ENST00000570016 POLKQ9UBT6 870 aa29.85■■■□□ 2.37
CDIPT-210ENST00000570016 NCAPD2Q15021 1401 aa29.84■■■□□ 2.37
CDIPT-210ENST00000570016 SHANK3Q9BYB0 1731 aa29.82■■■□□ 2.36
CDIPT-210ENST00000570016 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
CDIPT-210ENST00000570016 KCNQ2O43526 872 aa29.79■■■□□ 2.36
CDIPT-210ENST00000570016 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
CDIPT-210ENST00000570016 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CDIPT-210ENST00000570016 PROM2Q8N271 834 aa29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms