RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561637.5

NME3-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-202ENST00000561637 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.89■■■■□ 3.34
NME3-202ENST00000561637 CASZ1Q86V15 1759 aa35.89■■■■□ 3.34
NME3-202ENST00000561637 SLIT3O75094 1523 aa35.88■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.88■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 PTF1AQ7RTS3 328 aa35.88■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.88■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.87■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 PLSCR1O15162 318 aa35.84■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 WNK3Q9BYP7 1800 aa35.84■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 COL18A1P39060 1754 aa35.84■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.83■■■■□ 3.33
NME3-202ENST00000561637 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.8■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 DDB1Q16531 1140 aa35.8■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.79■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 DCAF8L1A6NGE4 600 aa35.79■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 TESK2Q96S53 571 aa35.79■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.78■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 SOX12O15370 315 aa35.78■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 PROM2Q8N271 834 aa35.78■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 TMC1Q8TDI8 760 aa35.78■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.78■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.78■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 RGPD5Q99666 1765 aa35.78■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa35.76■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
NME3-202ENST00000561637 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.75■■■■□ 3.31
NME3-202ENST00000561637 AXIN2Q9Y2T1 843 aa35.75■■■■□ 3.31
NME3-202ENST00000561637 MYOM1P52179 1685 aa35.75■■■■□ 3.31
NME3-202ENST00000561637 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
NME3-202ENST00000561637 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.74■■■■□ 3.31
NME3-202ENST00000561637 ZBTB7AO95365 584 aa35.71■■■■□ 3.31
NME3-202ENST00000561637 NME9Q86XW9 330 aa35.71■■■■□ 3.31
NME3-202ENST00000561637 NFAT5O94916 1531 aa35.7■■■■□ 3.31
NME3-202ENST00000561637 WDR17Q8IZU2 1322 aa35.69■■■■□ 3.3
NME3-202ENST00000561637 A0A1W2PP64 1363 aa35.68■■■■□ 3.3
NME3-202ENST00000561637 PTGER2P43116 358 aa35.68■■■■□ 3.3
NME3-202ENST00000561637 ARHGEF25Q86VW2 580 aa35.68■■■■□ 3.3
NME3-202ENST00000561637 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
NME3-202ENST00000561637 UTRNP46939 3433 aa35.66■■■■□ 3.3
NME3-202ENST00000561637 BCL9O00512 1426 aa35.66■■■■□ 3.3
NME3-202ENST00000561637 USP47Q96K76 1375 aa35.65■■■■□ 3.3
NME3-202ENST00000561637 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
NME3-202ENST00000561637 USP31Q70CQ4 1352 aa35.63■■■■□ 3.29
NME3-202ENST00000561637 TXNRD1Q16881 649 aa35.62■■■■□ 3.29
NME3-202ENST00000561637 KCNH5Q8NCM2 988 aa35.62■■■■□ 3.29
NME3-202ENST00000561637 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
NME3-202ENST00000561637 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
NME3-202ENST00000561637 USP54Q70EL1 1684 aa35.59■■■■□ 3.29
NME3-202ENST00000561637 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
NME3-202ENST00000561637 SLC15A2Q16348 729 aa35.57■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 CARD10Q9BWT7 1032 aa35.57■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 STK32BQ9NY57 414 aa35.57■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.57■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 CHD4Q14839 1912 aa35.55■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 SYT17Q9BSW7 474 aa35.55■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa35.54■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 EXOC5O00471 708 aa35.52■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 SGIP1Q9BQI5 828 aa35.51■■■■□ 3.28
NME3-202ENST00000561637 NHSQ6T4R5 1651 aa35.5■■■■□ 3.27
NME3-202ENST00000561637 CLSPNQ9HAW4 1339 aa35.5■■■■□ 3.27
NME3-202ENST00000561637 LTN1O94822 1766 aa35.48■■■■□ 3.27
NME3-202ENST00000561637 MTFR1LQ9H019 292 aa35.47■■■■□ 3.27
NME3-202ENST00000561637 TMF1P82094 1093 aa35.46■■■■□ 3.27
NME3-202ENST00000561637 TNS2Q63HR2 1409 aa35.46■■■■□ 3.27
NME3-202ENST00000561637 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.45■■■■□ 3.27
NME3-202ENST00000561637 KAT6BQ8WYB5 2073 aa35.44■■■■□ 3.26
NME3-202ENST00000561637 PAPPAQ13219 1627 aa35.44■■■■□ 3.26
NME3-202ENST00000561637 ABCC6O95255 1503 aa35.44■■■■□ 3.26
NME3-202ENST00000561637 CCDC7Q96M83 1385 aa35.44■■■■□ 3.26
NME3-202ENST00000561637 ACSBG1Q96GR2 724 aa35.44■■■■□ 3.26
NME3-202ENST00000561637 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.43■■■■□ 3.26
NME3-202ENST00000561637 BTAF1O14981 1849 aa35.42■■■■□ 3.26
NME3-202ENST00000561637 FBLN1P23142 703 aa35.42■■■■□ 3.26
NME3-202ENST00000561637 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
NME3-202ENST00000561637 ERBB3P21860 1342 aa35.38■■■■□ 3.25
NME3-202ENST00000561637 SLC24A1O60721 1099 aa35.38■■■■□ 3.25
NME3-202ENST00000561637 ARXQ96QS3 562 aa35.37■■■■□ 3.25
NME3-202ENST00000561637 ANKRD24Q8TF21 1146 aa35.35■■■■□ 3.25
NME3-202ENST00000561637 ZNF827Q17R98 1081 aa35.34■■■■□ 3.25
NME3-202ENST00000561637 NLRP2Q9NX02 1062 aa35.34■■■■□ 3.25
NME3-202ENST00000561637 COG3Q96JB2 828 aa35.33■■■■□ 3.25
NME3-202ENST00000561637 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.31■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 MAP3K19Q56UN5 1328 aa35.31■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 LRRC4BQ9NT99 713 aa35.3■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 MAP3K5Q99683 1374 aa35.29■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.29■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 FYB1O15117 783 aa35.29■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 IL2RBP14784 551 aa35.28■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 C1QTNF8P60827 252 aa35.28■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 IP6K1Q92551 441 aa35.28■■■■□ 3.24
NME3-202ENST00000561637 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms