RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552296.6

PCBP2-222, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PCBP2, Length 1,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-222	ENST00000552296	PDE3B	Q13370	1112 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PCBP2-222	ENST00000552296	CABP2	Q9NPB3	220 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PCBP2-222	ENST00000552296	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PCBP2-222	ENST00000552296	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PCBP2-222	ENST00000552296	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PCBP2-222	ENST00000552296	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PCBP2-222	ENST00000552296	BCL9	O00512	1426 aa		12.96	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	NFAT5	O94916	1531 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	CABP1	Q9NZU7	370 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	PLSCR1	O15162	318 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	ABCC6	O95255	1503 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	LTN1	O94822	1766 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	NLRP6	P59044	892 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	PROM2	Q8N271	834 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	MYOM1	P52179	1685 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	NHS	Q6T4R5	1651 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	NBPF14	Q5TI25	921 aa		12.9	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	12.9	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		12.9	□□□□□ -0.34
PCBP2-222	ENST00000552296	PAPPA	Q13219	1627 aa		12.9	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	KCNQ2	O43526	872 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	DDB1	Q16531	1140 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	SPON1	Q9HCB6	807 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	BTAF1	O14981	1849 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	TNS2	Q63HR2	1409 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	CHD4	Q14839	1912 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	USP31	Q70CQ4	1352 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	PTGER2	P43116	358 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	YY1	P25490	414 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		12.83	□□□□□ -0.35
PCBP2-222	ENST00000552296	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	CCDC7	Q96M83	1385 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	ERBB3	P21860	1342 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	EXOC5	O00471	708 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC15A2	Q16348	729 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	LY75	O60449	1722 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	SOX12	O15370	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	ZBTB7A	O95365	584 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PCBP2-222	ENST00000552296	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	NME9	Q86XW9	330 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	STK32B	Q9NY57	414 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296		A0A1W2PP64	1363 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	MAP3K5	Q99683	1374 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	SYT17	Q9BSW7	474 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	MTFR1L	Q9H019	292 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12.75	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	IL2RB	P14784	551 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		12.74	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	NEUROD1	Q13562	356 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		12.73	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	NSD2	O96028	1365 aa		12.72	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.71	□□□□□ -0.37
PCBP2-222	ENST00000552296	IP6K1	Q92551	441 aa		12.7	□□□□□ -0.38

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