RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 AAMPQ13685 434 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 USP6P35125 1406 aa10.11□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 ACEP12821 1306 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 NUTM2FA1L443 756 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 E9PSI1 815 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 COG3Q96JB2 828 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 POLKQ9UBT6 870 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 ANKARQ7Z5J8 1434 aa10.1□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 PRR29P0C7W0 189 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 WWC1Q8IX03 1113 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 TCP11L2Q8N4U5 519 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 FMN2Q9NZ56 1722 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa10.09□□□□□ -0.79
CS-204ENST00000546621 CCDC27Q2M243 656 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 ZRANB1Q9UGI0 708 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 NALCNQ8IZF0 1738 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 OVOS2Q6IE36 1432 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 SSH2Q76I76 1423 aa10.08□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 PLEKHF1Q96S99 279 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 FBLN1P23142 703 aa10.07□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 TTC21AQ8NDW8 1320 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 NEUROD2Q15784 382 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 WDR63Q8IWG1 891 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 FAM43AQ8N2R8 423 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa10.06□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 NWD1Q149M9 1564 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 NBR1Q14596 966 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 USP31Q70CQ4 1352 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa10.05□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 LRRC7Q96NW7 1537 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 C19orf67A6NJJ6 358 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 FCHSD2O94868 740 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 CERKQ8TCT0 537 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 IL13P35225 146 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 TMPOP42166 694 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 PIK3C2AO00443 1686 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 PLIN1O60240 522 aa10.02□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 RBM10P98175 930 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.8
CS-204ENST00000546621 USP54Q70EL1 1684 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 EXOC6Q8TAG9 804 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 PEAK1Q9H792 1746 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 NEFMP07197 916 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 PRKAR2BP31323 418 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 IL16Q14005 1332 aa10□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 RIPK4P57078 832 aa10□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 EVX2Q03828 476 aa10□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 PHF8Q9UPP1 1060 aa10□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 HMOX1P09601 288 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 CRBNQ96SW2 442 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 HSPA2P54652 639 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 NFE2L2Q16236 605 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 C20orf194Q5TEA3 1177 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 CHADLQ6NUI6 762 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 C14orf37Q86TY3 774 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 RGPD1P0DJD0 1748 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 SBNO1A3KN83 1393 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 MAP3K19Q56UN5 1328 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 BCAR3O75815 825 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 NLRP6P59044 892 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 FLT4P35916 1363 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 SOX12O15370 315 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
CS-204ENST00000546621 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
CS-204ENST00000546621 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-204ENST00000546621 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-204ENST00000546621 ARHGEF10O15013 1369 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-204ENST00000546621 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms