RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542238.5

RTN3-211, Transcript of reticulon 3, humanhuman

TSL 3

Gene RTN3, Length 735 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3-211ENST00000542238 SPON1Q9HCB6 807 aa22.12■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.12■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 PLSCR1O15162 318 aa22.11■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 AKAP12Q02952 1782 aa22.11■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 RGPD5Q99666 1765 aa22.1■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 AXIN2Q9Y2T1 843 aa22.1■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa22.09■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 KCNQ2O43526 872 aa22.09■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa22.09■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 TTC21AQ8NDW8 1320 aa22.08■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 ARHGEF25Q86VW2 580 aa22.08■■□□□ 1.13
RTN3-211ENST00000542238 SOX12O15370 315 aa22.07■■□□□ 1.12
RTN3-211ENST00000542238 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.06■■□□□ 1.12
RTN3-211ENST00000542238 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.06■■□□□ 1.12
RTN3-211ENST00000542238 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.05■■□□□ 1.12
RTN3-211ENST00000542238 NEUROD1Q13562 356 aa22.05■■□□□ 1.12
RTN3-211ENST00000542238 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
RTN3-211ENST00000542238 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RTN3-211ENST00000542238 EXOC5O00471 708 aa22.03■■□□□ 1.12
RTN3-211ENST00000542238 BCL9O00512 1426 aa22.03■■□□□ 1.12
RTN3-211ENST00000542238 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.01■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 YY1P25490 414 aa22.01■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.01■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 NFAT5O94916 1531 aa22.01■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 ABCC6O95255 1503 aa22.01■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 CCDC7Q96M83 1385 aa22■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 MON2Q7Z3U7 1717 aa22■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 CASZ1Q86V15 1759 aa21.98■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 PROM2Q8N271 834 aa21.97■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 STK32BQ9NY57 414 aa21.96■■□□□ 1.11
RTN3-211ENST00000542238 TXNRD1Q16881 649 aa21.95■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.95■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 USP31Q70CQ4 1352 aa21.94■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 TNS2Q63HR2 1409 aa21.94■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 USP54Q70EL1 1684 aa21.94■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 LTN1O94822 1766 aa21.94■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 TMC1Q8TDI8 760 aa21.93■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.93■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.93■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 ZBTB7AO95365 584 aa21.92■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.92■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 ERBB3P21860 1342 aa21.91■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 SLC15A2Q16348 729 aa21.91■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 NME9Q86XW9 330 aa21.91■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 NHSQ6T4R5 1651 aa21.91■■□□□ 1.1
RTN3-211ENST00000542238 IL2RBP14784 551 aa21.89■■□□□ 1.09
RTN3-211ENST00000542238 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
RTN3-211ENST00000542238 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.88■■□□□ 1.09
RTN3-211ENST00000542238 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.88■■□□□ 1.09
RTN3-211ENST00000542238 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.88■■□□□ 1.09
RTN3-211ENST00000542238 MYOM1P52179 1685 aa21.88■■□□□ 1.09
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RTN3-211ENST00000542238 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.86■■□□□ 1.09
RTN3-211ENST00000542238 MTFR1LQ9H019 292 aa21.85■■□□□ 1.09
RTN3-211ENST00000542238 BTAF1O14981 1849 aa21.84■■□□□ 1.09
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RTN3-211ENST00000542238 TONSLQ96HA7 1378 aa21.82■■□□□ 1.08
RTN3-211ENST00000542238 A0A1W2PP64 1363 aa21.81■■□□□ 1.08
RTN3-211ENST00000542238 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RTN3-211ENST00000542238 SYT17Q9BSW7 474 aa21.8■■□□□ 1.08
RTN3-211ENST00000542238 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RTN3-211ENST00000542238 IP6K1Q92551 441 aa21.79■■□□□ 1.08
RTN3-211ENST00000542238 PAPPAQ13219 1627 aa21.78■■□□□ 1.08
RTN3-211ENST00000542238 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
RTN3-211ENST00000542238 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 ARXQ96QS3 562 aa21.76■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.76■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 SLC24A1O60721 1099 aa21.75■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 COG3Q96JB2 828 aa21.75■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 CHD4Q14839 1912 aa21.74■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 ZNF827Q17R98 1081 aa21.73■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.73■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.73■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 AMPHP49418 695 aa21.72■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.71■■□□□ 1.07
RTN3-211ENST00000542238 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.7■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 HOXC9P31274 260 aa21.7■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.7■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 TESK2Q96S53 571 aa21.7■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.7■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 AKT1S1Q96B36 256 aa21.69■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 MAP3K5Q99683 1374 aa21.69■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 RGPD2P0DJD1 1756 aa21.69■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.68■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.68■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 POLD1P28340 1107 aa21.67■■□□□ 1.06
RTN3-211ENST00000542238 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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