RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537143.5

ATG16L2-208, Transcript of autophagy related 16 like 2, human

TSL 2

Gene ATG16L2, Length 519 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG16L2-208	ENST00000537143	BAG6	P46379	1132 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ATG16L2-208	ENST00000537143	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
ATG16L2-208	ENST00000537143	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		32.29	■■■□□ 2.76
ATG16L2-208	ENST00000537143	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ATG16L2-208	ENST00000537143	TMC1	Q8TDI8	760 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ATG16L2-208	ENST00000537143	PEAK1	Q9H792	1746 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ATG16L2-208	ENST00000537143	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ATG16L2-208	ENST00000537143	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
ATG16L2-208	ENST00000537143	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		32.27	■■■□□ 2.76
ATG16L2-208	ENST00000537143	ABCC6	O95255	1503 aa		32.26	■■■□□ 2.75
ATG16L2-208	ENST00000537143	TRIM37	O94972	964 aa		32.25	■■■□□ 2.75
ATG16L2-208	ENST00000537143	PDE3B	Q13370	1112 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ATG16L2-208	ENST00000537143	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ATG16L2-208	ENST00000537143	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ATG16L2-208	ENST00000537143	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ATG16L2-208	ENST00000537143	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
ATG16L2-208	ENST00000537143	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ATG16L2-208	ENST00000537143	USP47	Q96K76	1375 aa		32.2	■■■□□ 2.75
ATG16L2-208	ENST00000537143	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.19	■■■□□ 2.74
ATG16L2-208	ENST00000537143	LTN1	O94822	1766 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ATG16L2-208	ENST00000537143	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ATG16L2-208	ENST00000537143	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		32.17	■■■□□ 2.74
ATG16L2-208	ENST00000537143	RREB1	Q92766	1687 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ATG16L2-208	ENST00000537143	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ATG16L2-208	ENST00000537143	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
ATG16L2-208	ENST00000537143	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	APBA3	O96018	575 aa		32.12	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	ERBB3	P21860	1342 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	DDB1	Q16531	1140 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	LRP5	O75197	1615 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		32.09	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ATG16L2-208	ENST00000537143	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.07	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	BCL9	O00512	1426 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	SLC24A1	O60721	1099 aa		32.05	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	MYOM1	P52179	1685 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	FBLN1	P23142	703 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	TMF1	P82094	1093 aa		32.03	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.02	■■■□□ 2.72
ATG16L2-208	ENST00000537143	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		32.01	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		31.99	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	IP6K1	Q92551	441 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		31.98	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		31.97	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	FYB1	O15117	783 aa		31.96	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	COG3	Q96JB2	828 aa		31.95	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
ATG16L2-208	ENST00000537143	EXOC5	O00471	708 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	31.92	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		31.92	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	PLSCR1	O15162	318 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	IL2RB	P14784	551 aa		31.9	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	HOXC9	P31274	260 aa		31.9	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	PROM2	Q8N271	834 aa		31.9	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	NHS	Q6T4R5	1651 aa		31.89	■■■□□ 2.7
ATG16L2-208	ENST00000537143	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		31.88	■■■□□ 2.69
ATG16L2-208	ENST00000537143	KCNQ2	O43526	872 aa		31.87	■■■□□ 2.69
ATG16L2-208	ENST00000537143	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
ATG16L2-208	ENST00000537143	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
ATG16L2-208	ENST00000537143	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
ATG16L2-208	ENST00000537143	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ATG16L2-208	ENST00000537143	RTL1	A6NKG5	1358 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ATG16L2-208	ENST00000537143	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		31.83	■■■□□ 2.69
ATG16L2-208	ENST00000537143	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ATG16L2-208	ENST00000537143	AMPH	P49418	695 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ATG16L2-208	ENST00000537143	MEGF6	O75095	1541 aa		31.8	■■■□□ 2.68
ATG16L2-208	ENST00000537143	NBPF14	Q5TI25	921 aa		31.79	■■■□□ 2.68
ATG16L2-208	ENST00000537143	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ATG16L2-208	ENST00000537143	CASZ1	Q86V15	1759 aa		31.76	■■■□□ 2.68
ATG16L2-208	ENST00000537143	BTAF1	O14981	1849 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	NBPF4	Q96M43	638 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.74	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	INSR	P06213	1382 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	31.72	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	PAPPA	Q13219	1627 aa		31.71	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		31.7	■■■□□ 2.67
ATG16L2-208	ENST00000537143	FLT4	P35916	1363 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ATG16L2-208	ENST00000537143	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ATG16L2-208	ENST00000537143	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		31.68	■■■□□ 2.66
ATG16L2-208	ENST00000537143	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
ATG16L2-208	ENST00000537143	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.66	■■■□□ 2.66

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