RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 IL13P35225 146 aa28.97■■■□□ 2.23
KCNS1-202ENST00000537075 TRIM27P14373 513 aa28.95■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.95■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.94■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 HMOX1P09601 288 aa28.94■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 NFE2L2Q16236 605 aa28.93■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.92■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 COG3Q96JB2 828 aa28.92■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.91■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 KCNA6P17658 529 aa28.9■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
KCNS1-202ENST00000537075 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 NEFMP07197 916 aa28.88■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa28.88■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.87■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.86■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 USP19O94966 1318 aa28.85■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 KIF16BQ96L93 1317 aa28.85■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 DDX19BQ9UMR2 479 aa28.84■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.83■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.83■■■□□ 2.21
KCNS1-202ENST00000537075 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.82■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.82■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.82■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 ACEP12821 1306 aa28.81■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.81■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 ZNF853P0CG23 659 aa28.81■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 USP6P35125 1406 aa28.8■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 PEAK1Q9H792 1746 aa28.8■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 SEC24BO95487 1268 aa28.79■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 ZNF428Q96B54 188 aa28.79■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 IFT57Q9NWB7 429 aa28.79■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 SLC4A3P48751 1232 aa28.78■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 NWD1Q149M9 1564 aa28.77■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.77■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 VAMP4O75379 141 aa28.76■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.76■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 GNAI1P63096 354 aa28.76■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 SSH2Q76I76 1423 aa28.76■■■□□ 2.2
KCNS1-202ENST00000537075 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 MBIPQ9NS73 344 aa28.75■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.75■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 NUTM2FA1L443 756 aa28.75■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 TSPYL6Q8N831 410 aa28.75■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.72■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 USP31Q70CQ4 1352 aa28.72■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 HSPA2P54652 639 aa28.72■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.72■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 CFAP44Q96MT7 982 aa28.7■■■□□ 2.19
KCNS1-202ENST00000537075 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.7■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 FAM83GA6ND36 823 aa28.7■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.7■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 SMC5Q8IY18 1101 aa28.7■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.67■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 USP35Q9P2H5 1018 aa28.67■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.67■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 DCTN1Q14203 1278 aa28.65■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.65■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.65■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 STRCQ7RTU9 1775 aa28.64■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
KCNS1-202ENST00000537075 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa28.63■■■□□ 2.17
KCNS1-202ENST00000537075 PIK3C2AO00443 1686 aa28.63■■■□□ 2.17
KCNS1-202ENST00000537075 ABCC4O15439 1325 aa28.62■■■□□ 2.17
KCNS1-202ENST00000537075 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.62■■■□□ 2.17
KCNS1-202ENST00000537075 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
KCNS1-202ENST00000537075 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.6■■■□□ 2.17
KCNS1-202ENST00000537075 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
KCNS1-202ENST00000537075 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.59■■■□□ 2.17
KCNS1-202ENST00000537075 C14orf37Q86TY3 774 aa28.58■■■□□ 2.17
KCNS1-202ENST00000537075 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 MAP3K19Q56UN5 1328 aa28.57■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 NUCB1Q02818 461 aa28.56■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 ARHGEF10O15013 1369 aa28.55■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 NFKBIBQ15653 356 aa28.54■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 SOX12O15370 315 aa28.54■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 SBNO1A3KN83 1393 aa28.54■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 FLT4P35916 1363 aa28.52■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 CHL1O00533 1208 aa28.52■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 USP54Q70EL1 1684 aa28.52■■■□□ 2.16
KCNS1-202ENST00000537075 MCM10Q7L590 875 aa28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms