RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536420.5

ACVR1B-204, Transcript of activin A receptor type 1B, humanhuman

TSL 4

Gene ACVR1B, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1B-204ENST00000536420 DDB1Q16531 1140 aa34.27■■■■□ 3.08
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ACVR1B-204ENST00000536420 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.27■■■■□ 3.08
ACVR1B-204ENST00000536420 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.27■■■■□ 3.08
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ACVR1B-204ENST00000536420 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.21■■■■□ 3.07
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ACVR1B-204ENST00000536420 USP54Q70EL1 1684 aa34.16■■■■□ 3.06
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ACVR1B-204ENST00000536420 CD163L1Q9NR16 1453 aa34.12■■■■□ 3.05
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ACVR1B-204ENST00000536420 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
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ACVR1B-204ENST00000536420 LTN1O94822 1766 aa34.06■■■■□ 3.04
ACVR1B-204ENST00000536420 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.03■■■■□ 3.04
ACVR1B-204ENST00000536420 ERBB3P21860 1342 aa34.03■■■■□ 3.04
ACVR1B-204ENST00000536420 A0A1W2PP64 1363 aa34■■■■□ 3.03
ACVR1B-204ENST00000536420 SPON1Q9HCB6 807 aa34■■■■□ 3.03
ACVR1B-204ENST00000536420 TNS2Q63HR2 1409 aa33.99■■■■□ 3.03
ACVR1B-204ENST00000536420 NLRP2Q9NX02 1062 aa33.98■■■■□ 3.03
ACVR1B-204ENST00000536420 KCNQ2O43526 872 aa33.96■■■■□ 3.03
ACVR1B-204ENST00000536420 PTF1AQ7RTS3 328 aa33.96■■■■□ 3.03
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ACVR1B-204ENST00000536420 ANKRD24Q8TF21 1146 aa33.94■■■■□ 3.02
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ACVR1B-204ENST00000536420 BTAF1O14981 1849 aa33.76■■■□□ 2.99
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ACVR1B-204ENST00000536420 PAPPAQ13219 1627 aa33.64■■■□□ 2.98
ACVR1B-204ENST00000536420 FBLN1P23142 703 aa33.64■■■□□ 2.98
ACVR1B-204ENST00000536420 SLC27A3Q5K4L6 730 aa33.64■■■□□ 2.98
ACVR1B-204ENST00000536420 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
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ACVR1B-204ENST00000536420 CGNL1Q0VF96 1302 aa33.62■■■□□ 2.97
ACVR1B-204ENST00000536420 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
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ACVR1B-204ENST00000536420 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
ACVR1B-204ENST00000536420 MYOM1P52179 1685 aa33.6■■■□□ 2.97
ACVR1B-204ENST00000536420 KIF20BQ96Q89 1820 aa33.6■■■□□ 2.97
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ACVR1B-204ENST00000536420 LRRC4BQ9NT99 713 aa33.58■■■□□ 2.97
ACVR1B-204ENST00000536420 NBPF6Q5VWK0 638 aa33.56■■■□□ 2.96
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