RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534510.5

CTSB-232, Transcript of cathepsin B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTSB, Length 1,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSB-232ENST00000534510 DLG5Q8TDM6 1919 aa22.17■■□□□ 1.14
CTSB-232ENST00000534510 VAMP4O75379 141 aa22.16■■□□□ 1.14
CTSB-232ENST00000534510 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.16■■□□□ 1.14
CTSB-232ENST00000534510 ITSN1Q15811 1721 aa22.16■■□□□ 1.14
CTSB-232ENST00000534510 AKAP12Q02952 1782 aa22.16■■□□□ 1.14
CTSB-232ENST00000534510 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.16■■□□□ 1.14
CTSB-232ENST00000534510 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa22.16■■□□□ 1.14
CTSB-232ENST00000534510 LNPKQ9C0E8 428 aa22.14■■□□□ 1.14
CTSB-232ENST00000534510 ZNF853P0CG23 659 aa22.14■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 NME9Q86XW9 330 aa22.14■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 GCC1Q96CN9 775 aa22.14■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 HSCBQ8IWL3 235 aa22.13■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.13■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 C3P01024 1663 aa22.13■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 ABCC4O15439 1325 aa22.12■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 MBIPQ9NS73 344 aa22.12■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.11■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 CPS1P31327 1500 aa22.11■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.11■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 COG3Q96JB2 828 aa22.11■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.11■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 TECPR2O15040 1411 aa22.11■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 TSPYL6Q8N831 410 aa22.1■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 METP08581 1390 aa22.1■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.1■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 SIRT1Q96EB6 747 aa22.08■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 CFAP44Q96MT7 982 aa22.08■■□□□ 1.13
CTSB-232ENST00000534510 MCM4P33991 863 aa22.08■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.08■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.08■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.07■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 SNX21Q969T3 373 aa22.07■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.07■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.06■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.05■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.05■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 MLECQ14165 292 aa22.03■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.03■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CTSB-232ENST00000534510 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.01■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 DDIT3P35638 169 aa21.99■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.99■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 FAM83GA6ND36 823 aa21.99■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.98■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.98■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.98■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.96■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.96■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 CDC45O75419 566 aa21.96■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 DCTN1Q14203 1278 aa21.96■■□□□ 1.11
CTSB-232ENST00000534510 TNRQ92752 1358 aa21.95■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.95■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 TRAK2O60296 914 aa21.95■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 RGPD1P0DJD0 1748 aa21.94■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa21.94■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 OVOS2Q6IE36 1432 aa21.94■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 FSD2A1L4K1 749 aa21.94■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 KIF2CQ99661 725 aa21.94■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.94■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa21.93■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 KIAA0232Q92628 1395 aa21.93■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.93■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 DCTPP1Q9H773 170 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 AEBP1Q8IUX7 1158 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 PEAK1Q9H792 1746 aa21.92■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 RGS12O14924 1447 aa21.91■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 CHL1O00533 1208 aa21.9■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 ATP10DQ9P241 1426 aa21.9■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.9■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.9■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 USP6P35125 1406 aa21.89■■□□□ 1.1
CTSB-232ENST00000534510 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CTSB-232ENST00000534510 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.89■■□□□ 1.09
CTSB-232ENST00000534510 GBP4Q96PP9 640 aa21.89■■□□□ 1.09
CTSB-232ENST00000534510 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CTSB-232ENST00000534510 PTPRCP08575 1304 aa21.89■■□□□ 1.09
CTSB-232ENST00000534510 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.3 ms