RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.44■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.43■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 PLSCR1O15162 318 aa23.42■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 CDCA8Q53HL2 280 aa23.42■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.42■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.42■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.42■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.42■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 CCDC7Q96M83 1385 aa23.41■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 SYT17Q9BSW7 474 aa23.41■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 CDK19Q9BWU1 502 aa23.41■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 CPDO75976 1380 aa23.4■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.39■■□□□ 1.34
PACS1-208ENST00000529677 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.39■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 EVA1CP58658 441 aa23.37■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 USP19O94966 1318 aa23.35■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 CABP2Q9NPB3 220 aa23.35■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
PACS1-208ENST00000529677 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.33■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 CRB1P82279 1406 aa23.32■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 PAPPAQ13219 1627 aa23.3■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 AKAP12Q02952 1782 aa23.3■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.3■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 COL18A1P39060 1754 aa23.29■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 BCL9O00512 1426 aa23.29■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.29■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 CD163L1Q9NR16 1453 aa23.28■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.27■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 ACEP12821 1306 aa23.27■■□□□ 1.32
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K5Q99683 1374 aa23.27■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 SLC15A2Q16348 729 aa23.26■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 TXNRD1Q16881 649 aa23.25■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 MTFR1LQ9H019 292 aa23.25■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 MON2Q7Z3U7 1717 aa23.24■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 GCP02774 474 aa23.23■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.23■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa23.23■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 DDB1Q16531 1140 aa23.22■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 CABP1Q9NZU7 370 aa23.22■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 SLIT3O75094 1523 aa23.22■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 COL24A1Q17RW2 1714 aa23.22■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 ABTB2Q8N961 1025 aa23.21■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.21■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 STK32BQ9NY57 414 aa23.21■■□□□ 1.31
PACS1-208ENST00000529677 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.2■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 NHSQ6T4R5 1651 aa23.19■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 A0A1W2PP64 1363 aa23.19■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 ARXQ96QS3 562 aa23.19■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 TMC1Q8TDI8 760 aa23.18■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 RGPD5Q99666 1765 aa23.17■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.17■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 USP6P35125 1406 aa23.16■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 AXIN2Q9Y2T1 843 aa23.15■■□□□ 1.3
PACS1-208ENST00000529677 PIK3C2AO00443 1686 aa23.14■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 PANK3Q9H999 370 aa23.13■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 ZNF827Q17R98 1081 aa23.12■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 NLRP13Q86W25 1043 aa23.12■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.11■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.11■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.11■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.11■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.1■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 GPR162Q16538 588 aa23.1■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 BTAF1O14981 1849 aa23.1■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 NSD3Q9BZ95 1437 aa23.09■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.09■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 USP54Q70EL1 1684 aa23.09■■□□□ 1.29
PACS1-208ENST00000529677 KIF20BQ96Q89 1820 aa23.08■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 TNS2Q63HR2 1409 aa23.07■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.06■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 NLGN2Q8NFZ4 835 aa23.06■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.05■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.05■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.05■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa23.04■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 ABCC6O95255 1503 aa23.03■■□□□ 1.28
PACS1-208ENST00000529677 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
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