RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	12.11	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	SLIT3	O75094	1523 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	BCL9	O00512	1426 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	USP6	P35125	1406 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	COL18A1	P39060	1754 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		12.1	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	LRRC37A3	O60309	1634 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	SYT17	Q9BSW7	474 aa		12.09	□□□□□ -0.47
MKNK1-222	ENST00000529170	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC15A2	Q16348	729 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		12.08	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	STK32B	Q9NY57	414 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	UTRN	P46939	3433 aa		12.07	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		12.06	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	EXOC5	O00471	708 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	SOX12	O15370	315 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	MYOM1	P52179	1685 aa		12.05	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	PIK3C2A	O00443	1686 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	MTFR1L	Q9H019	292 aa		12.04	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		12.03	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
MKNK1-222	ENST00000529170	ARX	Q96QS3	562 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	RGPD5	Q99666	1765 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		12.02	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	CCDC7	Q96M83	1385 aa		12.01	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	C1QTNF8	P60827	252 aa		12	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		12	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		12	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	NFAT5	O94916	1531 aa		12	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		12	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	AKAP12	Q02952	1782 aa		12	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	TNS2	Q63HR2	1409 aa		11.99	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.98	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	ERBB3	P21860	1342 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	AKT1S1	Q96B36	256 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.97	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	CHD4	Q14839	1912 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	USP31	Q70CQ4	1352 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	IL2RB	P14784	551 aa		11.96	□□□□□ -0.49
MKNK1-222	ENST00000529170	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49	2e-6	■□□□□ 9.3
MKNK1-222	ENST00000529170	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	GPR162	Q16538	588 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	NME9	Q86XW9	330 aa		11.95	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		11.94	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	ABCC6	O95255	1503 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	KCNQ4	P56696	695 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		11.93	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	BTAF1	O14981	1849 aa		11.92	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		11.91	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
MKNK1-222	ENST00000529170	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	POLD1	P28340	1107 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	IP6K1	Q92551	441 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		11.89	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	11.88	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	TMC1	Q8TDI8	760 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		11.88	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	FBLN1	P23142	703 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	NEUROD1	Q13562	356 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	NSD2	O96028	1365 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	USP54	Q70EL1	1684 aa		11.87	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		11.86	□□□□□ -0.51
MKNK1-222	ENST00000529170	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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