RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525778.5

SOGA3-203, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 4,077 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-203ENST00000525778 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC183Q5T5S1 534 aa21.71■■□□□ 1.07
SOGA3-203ENST00000525778 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SOGA3-203ENST00000525778 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SOGA3-203ENST00000525778 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
SOGA3-203ENST00000525778 FBXW7Q969H0 707 aa21.71■■□□□ 1.07
SOGA3-203ENST00000525778 TMX3Q96JJ7 454 aa21.71■■□□□ 1.07
SOGA3-203ENST00000525778 TTC22Q5TAA0 569 aa21.7■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 MBD5Q9P267 1494 aa21.7■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 H3BQV1 296 aa21.69■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 IFFO2Q5TF58 517 aa21.69■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 HOMER1Q86YM7 354 aa21.69■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 SDSP20132 328 aa21.68■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 A2MP01023 1474 aa21.68■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 PKP1Q13835 747 aa21.68■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.68■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.68■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.67■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.67■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.67■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 FCHSD2O94868 740 aa21.66■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 TEX35Q5T0J7 233 aa21.66■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 TAF3Q5VWG9 929 aa21.66■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.66■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 ABCC11Q96J66 1382 aa21.66■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 WDR62O43379 1518 aa21.65■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 NUP160Q12769 1436 aa21.65■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 ZMYM3Q14202 1370 aa21.65■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 SYNJ2O15056 1496 aa21.65■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 COG3Q96JB2 828 aa21.65■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 SLC4A2P04920 1241 aa21.65■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 TPM4P67936 248 aa21.64■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 CAMK4Q16566 473 aa21.64■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 UVSSAQ2YD98 709 aa21.64■■□□□ 1.06
SOGA3-203ENST00000525778 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.64■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.64■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 GPATCH3Q96I76 525 aa21.64■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 SAMD9Q5K651 1589 aa21.64■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 USP48Q86UV5 1035 aa21.63■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 TNMDQ9H2S6 317 aa21.63■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.63■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 USP26Q9BXU7 913 aa21.63■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 TNNT1P13805 278 aa21.63■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 NFE2L2Q16236 605 aa21.63■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.62■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.62■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.62■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 DCTN1Q14203 1278 aa21.62■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.61■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 FERMT3Q86UX7 667 aa21.61■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.61■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.61■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 GORABQ5T7V8 394 aa21.6■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.6■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 GNAI2P04899 355 aa21.6■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 NUTM2FA1L443 756 aa21.6■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 KRT85P78386 507 aa21.6■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.6■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.6■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 MNS1Q8NEH6 495 aa21.59■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 FOSBP53539 338 aa21.59■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 ADGRL2O95490 1459 aa21.59■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 IL16Q14005 1332 aa21.59■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 GPT2Q8TD30 523 aa21.59■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 GPS2Q13227 327 aa21.58■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 MAP3K11Q16584 847 aa21.58■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.58■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 KIF20AO95235 890 aa21.58■■□□□ 1.05
SOGA3-203ENST00000525778 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 CABP1Q9NZU7 370 aa21.58■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 CNPY2Q9Y2B0 182 aa21.57■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.57■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 GNAI3P08754 354 aa21.56■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC83Q8IWF9 413 aa21.56■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 TSPYL6Q8N831 410 aa21.56■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.55■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 MX1P20591 662 aa21.55■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 UBE2HP62256 183 aa21.55■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 PDE4CQ08493 712 aa21.55■■□□□ 1.04
SOGA3-203ENST00000525778 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 135.7 ms