RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 KCNH5Q8NCM2 988 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 LTN1O94822 1766 aa22.07■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 LRRC37A3O60309 1634 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.06■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 WDR17Q8IZU2 1322 aa22.04■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.03■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 ABCC6O95255 1503 aa22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SH3BP2-211ENST00000506932 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.01■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 PDE3BQ13370 1112 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 MYOM1P52179 1685 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 TRIM37O94972 964 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 BAG6P46379 1132 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 TMF1P82094 1093 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 PEAK1Q9H792 1746 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa21.98■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 DISP2A7MBM2 1401 aa21.97■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC24A1O60721 1099 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP2-211ENST00000506932 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP2-211ENST00000506932 ERBB3P21860 1342 aa21.93■■□□□ 1.1
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SH3BP2-211ENST00000506932 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-211ENST00000506932 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa21.92■■□□□ 1.1
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SH3BP2-211ENST00000506932 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-211ENST00000506932 DDB1Q16531 1140 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP2-211ENST00000506932 RREB1Q92766 1687 aa21.91■■□□□ 1.1
SH3BP2-211ENST00000506932 APBA3O96018 575 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-211ENST00000506932 COG3Q96JB2 828 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP2-211ENST00000506932 CCDC7Q96M83 1385 aa21.89■■□□□ 1.1
SH3BP2-211ENST00000506932 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.89■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 NLRP2Q9NX02 1062 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 MAP3K19Q56UN5 1328 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 FYB1O15117 783 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 CDCA8Q53HL2 280 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 TNS2Q63HR2 1409 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
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SH3BP2-211ENST00000506932 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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SH3BP2-211ENST00000506932 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.84■■□□□ 1.09
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SH3BP2-211ENST00000506932 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.82■■□□□ 1.08
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SH3BP2-211ENST00000506932 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 EXOC5O00471 708 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 LRP5O75197 1615 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 BCL9O00512 1426 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 IL2RBP14784 551 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 AMPHP49418 695 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
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SH3BP2-211ENST00000506932 NHSQ6T4R5 1651 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
SH3BP2-211ENST00000506932 SHANK3Q9BYB0 1731 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP2-211ENST00000506932 MEGF6O75095 1541 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP2-211ENST00000506932 KCNQ2O43526 872 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP2-211ENST00000506932 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-211ENST00000506932 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-211ENST00000506932 ACSBG1Q96GR2 724 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP2-211ENST00000506932 PLSCR1O15162 318 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-211ENST00000506932 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP2-211ENST00000506932 NBPF4Q96M43 638 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP2-211ENST00000506932 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.71■■□□□ 1.07
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SH3BP2-211ENST00000506932 PROM2Q8N271 834 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-211ENST00000506932 INSRP06213 1382 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP2-211ENST00000506932 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-211ENST00000506932 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-211ENST00000506932 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-211ENST00000506932 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-211ENST00000506932 DOT1LQ8TEK3 1739 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP2-211ENST00000506932 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SH3BP2-211ENST00000506932 KIF24Q5T7B8 1368 aa21.66■■□□□ 1.06
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