RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa43.29■■■■■ 4.52
ALYREF-202ENST00000505490 WDR17Q8IZU2 1322 aa43.28■■■■■ 4.52
ALYREF-202ENST00000505490 TTC21AQ8NDW8 1320 aa43.28■■■■■ 4.52
ALYREF-202ENST00000505490 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa43.28■■■■■ 4.52
ALYREF-202ENST00000505490 KCNH5Q8NCM2 988 aa43.26■■■■■ 4.52
ALYREF-202ENST00000505490 RGPD5Q99666 1765 aa43.25■■■■■ 4.51
ALYREF-202ENST00000505490 NFAT5O94916 1531 aa43.24■■■■■ 4.51
ALYREF-202ENST00000505490 NEUROD1Q13562 356 aa43.24■■■■■ 4.51
ALYREF-202ENST00000505490 ZBTB7CA1YPR0 619 aa43.23■■■■■ 4.51
ALYREF-202ENST00000505490 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa43.23■■■■■ 4.51
ALYREF-202ENST00000505490 BCL9O00512 1426 aa43.22■■■■■ 4.51
ALYREF-202ENST00000505490 MON2Q7Z3U7 1717 aa43.22■■■■■ 4.51
ALYREF-202ENST00000505490 DDB1Q16531 1140 aa43.2■■■■■ 4.51
ALYREF-202ENST00000505490 ABCC6O95255 1503 aa43.2■■■■■ 4.51
ALYREF-202ENST00000505490 USP54Q70EL1 1684 aa43.19■■■■■ 4.5
ALYREF-202ENST00000505490 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
ALYREF-202ENST00000505490 PLSCR1O15162 318 aa43.18■■■■■ 4.5
ALYREF-202ENST00000505490 NBPF14Q5TI25 921 aa43.18■■■■■ 4.5
ALYREF-202ENST00000505490 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
ALYREF-202ENST00000505490 CARD10Q9BWT7 1032 aa43.16■■■■■ 4.5
ALYREF-202ENST00000505490 USP31Q70CQ4 1352 aa43.14■■■■■ 4.5
ALYREF-202ENST00000505490 CD163L1Q9NR16 1453 aa43.13■■■■■ 4.5
ALYREF-202ENST00000505490 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
ALYREF-202ENST00000505490 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
ALYREF-202ENST00000505490 PTF1AQ7RTS3 328 aa43.07■■■■■ 4.49
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC7Q96M83 1385 aa43.04■■■■■ 4.48
ALYREF-202ENST00000505490 SOX12O15370 315 aa43.03■■■■■ 4.48
ALYREF-202ENST00000505490 CARD11Q9BXL7 1154 aa43.01■■■■■ 4.48
ALYREF-202ENST00000505490 PROM2Q8N271 834 aa43■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa42.99■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 CASZ1Q86V15 1759 aa42.98■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 SPON1Q9HCB6 807 aa42.97■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 KCNQ2O43526 872 aa42.96■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 TNS2Q63HR2 1409 aa42.96■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 LTN1O94822 1766 aa42.95■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 EXOC5O00471 708 aa42.95■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP42.95■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 ERBB3P21860 1342 aa42.95■■■■■ 4.47
ALYREF-202ENST00000505490 NME9Q86XW9 330 aa42.94■■■■■ 4.46
ALYREF-202ENST00000505490 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
ALYREF-202ENST00000505490 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa42.91■■■■■ 4.46
ALYREF-202ENST00000505490 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
ALYREF-202ENST00000505490 NHSQ6T4R5 1651 aa42.86■■■■■ 4.45
ALYREF-202ENST00000505490 A0A1W2PP64 1363 aa42.86■■■■■ 4.45
ALYREF-202ENST00000505490 TMC1Q8TDI8 760 aa42.85■■■■■ 4.45
ALYREF-202ENST00000505490 NINLQ9Y2I6 1382 aa42.85■■■■■ 4.45
ALYREF-202ENST00000505490 TONSLQ96HA7 1378 aa42.83■■■■■ 4.45
ALYREF-202ENST00000505490 TXNRD1Q16881 649 aa42.82■■■■■ 4.45
ALYREF-202ENST00000505490 TERF2IPQ9NYB0 399 aa42.81■■■■■ 4.44
ALYREF-202ENST00000505490 TESK2Q96S53 571 aa42.8■■■■■ 4.44
ALYREF-202ENST00000505490 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
ALYREF-202ENST00000505490 IL2RBP14784 551 aa42.77■■■■■ 4.44
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD24Q8TF21 1146 aa42.77■■■■■ 4.44
ALYREF-202ENST00000505490 NLRP2Q9NX02 1062 aa42.77■■■■■ 4.44
ALYREF-202ENST00000505490 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
ALYREF-202ENST00000505490 SLC15A2Q16348 729 aa42.72■■■■■ 4.43
ALYREF-202ENST00000505490 PAPPAQ13219 1627 aa42.71■■■■■ 4.43
ALYREF-202ENST00000505490 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
ALYREF-202ENST00000505490 IP6K1Q92551 441 aa42.7■■■■■ 4.43
ALYREF-202ENST00000505490 PTGER2P43116 358 aa42.69■■■■■ 4.42
ALYREF-202ENST00000505490 STK32BQ9NY57 414 aa42.69■■■■■ 4.42
ALYREF-202ENST00000505490 BTAF1O14981 1849 aa42.69■■■■■ 4.42
ALYREF-202ENST00000505490 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa42.66■■■■■ 4.42
ALYREF-202ENST00000505490 SLC24A1O60721 1099 aa42.65■■■■■ 4.42
ALYREF-202ENST00000505490 ACSBG1Q96GR2 724 aa42.65■■■■■ 4.42
ALYREF-202ENST00000505490 MYOM1P52179 1685 aa42.64■■■■■ 4.42
ALYREF-202ENST00000505490 ZBTB7AO95365 584 aa42.63■■■■■ 4.41
ALYREF-202ENST00000505490 SGIP1Q9BQI5 828 aa42.59■■■■■ 4.41
ALYREF-202ENST00000505490 KAT6BQ8WYB5 2073 aa42.58■■■■■ 4.41
ALYREF-202ENST00000505490 YY1P25490 414 aa42.58■■■■■ 4.41
ALYREF-202ENST00000505490 MAP3K19Q56UN5 1328 aa42.57■■■■■ 4.41
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa42.56■■■■■ 4.4
ALYREF-202ENST00000505490 COG3Q96JB2 828 aa42.55■■■■■ 4.4
ALYREF-202ENST00000505490 MTFR1LQ9H019 292 aa42.55■■■■■ 4.4
ALYREF-202ENST00000505490 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
ALYREF-202ENST00000505490 HOXC9P31274 260 aa42.53■■■■■ 4.4
ALYREF-202ENST00000505490 LRRC4BQ9NT99 713 aa42.51■■■■■ 4.4
ALYREF-202ENST00000505490 DCAF8L1A6NGE4 600 aa42.5■■■■■ 4.39
ALYREF-202ENST00000505490 SHANK3Q9BYB0 1731 aa42.49■■■■■ 4.39
ALYREF-202ENST00000505490 RGPD2P0DJD1 1756 aa42.49■■■■■ 4.39
ALYREF-202ENST00000505490 UTRNP46939 3433 aa42.48■■■■■ 4.39
ALYREF-202ENST00000505490 QSER1Q2KHR3 1735 aa42.47■■■■■ 4.39
ALYREF-202ENST00000505490 FBLN1P23142 703 aa42.47■■■■■ 4.39
ALYREF-202ENST00000505490 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
ALYREF-202ENST00000505490 RTL1A6NKG5 1358 aa42.47■■■■■ 4.39
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF827Q17R98 1081 aa42.45■■■■■ 4.39
ALYREF-202ENST00000505490 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 SLC27A3Q5K4L6 730 aa42.43■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 SYT17Q9BSW7 474 aa42.43■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 FYB1O15117 783 aa42.42■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 AMPHP49418 695 aa42.42■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 AKT1S1Q96B36 256 aa42.42■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 MEGF6O75095 1541 aa42.41■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 COL24A1Q17RW2 1714 aa42.4■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 DOT1LQ8TEK3 1739 aa42.4■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 NSD2O96028 1365 aa42.39■■■■■ 4.38
ALYREF-202ENST00000505490 LY75O60449 1722 aa42.39■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms