RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	CDCA8	Q53HL2	280 aa		10.58	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	BRD1	O95696	1058 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	SH3BP2	P78314	561 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	NCOA4	Q13772	614 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC125	Q86Z20	511 aa		10.57	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM32	Q13049	653 aa		10.56	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	RNF20	Q5VTR2	975 aa		10.56	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		10.56	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	WNT7B	P56706	349 aa		10.55	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	EML3	Q32P44	896 aa		10.55	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		10.55	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		10.55	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	ESPN	B1AK53	854 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L15	C9J2P7	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L10	C9JJH3	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L12	C9JPN9	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L11	C9JVI0	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L21	D6R901	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L18	D6R9N7	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L22	D6RA61	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L19	D6RCP7	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L20	D6RJB6	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	KCNA1	Q09470	495 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L24	Q0WX57	530 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		10.54	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	RPIA	P49247	311 aa		10.53	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM50	Q86XT4	487 aa		10.53	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	10.53	□□□□□ -0.72
ETV1-223	ENST00000497115	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	10.52	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	PTK7	Q13308	1070 aa		10.52	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		10.52	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		10.52	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	RASA1	P20936	1047 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	10.51	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	10.51	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	NOD1	Q9Y239	953 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	ATP1A2	P50993	1020 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	STK32A	Q8WU08	396 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	SKOR1	P84550	965 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	OGFOD1	Q8N543	542 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	SIRT1	Q96EB6	747 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	CARNS1	A5YM72	827 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	CLDN10	P78369	228 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	IFFO2	Q5TF58	517 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	SIX5	Q8N196	739 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		10.46	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
ETV1-223	ENST00000497115	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	GTF2I	P78347	998 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	USP4	Q13107	963 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	MPND	Q8N594	471 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	DPYD	Q12882	1025 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	DKK1	O94907	266 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM52	Q96A61	297 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ETV1-223	ENST00000497115	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms