RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TM2D1-211ENST00000496465 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.71■■□□□ 1.71
TM2D1-211ENST00000496465 ABCC6O95255 1503 aa25.7■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 PDE3BQ13370 1112 aa25.7■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.7■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.69■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.69■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 A0A1W2PP64 1363 aa25.68■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.68■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 SOX12O15370 315 aa25.67■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.67■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 NME9Q86XW9 330 aa25.67■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 LTN1O94822 1766 aa25.67■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.65■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.65■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 LRRC37A3O60309 1634 aa25.65■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 TRIM37O94972 964 aa25.64■■□□□ 1.7
TM2D1-211ENST00000496465 PEAK1Q9H792 1746 aa25.63■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 USP47Q96K76 1375 aa25.63■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 SBF2Q86WG5 1849 aa25.61■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.61■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.6■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.6■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 CAMKK2Q96RR4 588 aa25.59■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 DDB1Q16531 1140 aa25.58■■□□□ 1.69
TM2D1-211ENST00000496465 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.57■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.57■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 APBA3O96018 575 aa25.57■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.57■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 TMF1P82094 1093 aa25.57■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.57■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 RREB1Q92766 1687 aa25.56■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa25.55■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC7Q96M83 1385 aa25.55■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 ERBB3P21860 1342 aa25.54■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 LRP5O75197 1615 aa25.52■■□□□ 1.68
TM2D1-211ENST00000496465 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 BCL9O00512 1426 aa25.51■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.51■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.51■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 CDCA8Q53HL2 280 aa25.5■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 COG3Q96JB2 828 aa25.48■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 EXOC5O00471 708 aa25.47■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 ANKRD24Q8TF21 1146 aa25.47■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 IP6K1Q92551 441 aa25.47■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.47■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 MYOM1P52179 1685 aa25.46■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 TNS2Q63HR2 1409 aa25.46■■□□□ 1.67
TM2D1-211ENST00000496465 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.45■■□□□ 1.66
TM2D1-211ENST00000496465 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
TM2D1-211ENST00000496465 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TM2D1-211ENST00000496465 FYB1O15117 783 aa25.43■■□□□ 1.66
TM2D1-211ENST00000496465 PLSCR1O15162 318 aa25.43■■□□□ 1.66
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.42■■□□□ 1.66
TM2D1-211ENST00000496465 IL2RBP14784 551 aa25.41■■□□□ 1.66
TM2D1-211ENST00000496465 PTF1AQ7RTS3 328 aa25.4■■□□□ 1.66
TM2D1-211ENST00000496465 RGPD2P0DJD1 1756 aa25.39■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 FBLN1P23142 703 aa25.38■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 HOXC9P31274 260 aa25.38■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 NBPF14Q5TI25 921 aa25.38■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.38■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 NHSQ6T4R5 1651 aa25.37■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 RTL1A6NKG5 1358 aa25.36■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 AMPHP49418 695 aa25.36■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 CARD14Q9BXL6 1004 aa25.35■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.35■■□□□ 1.65
TM2D1-211ENST00000496465 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
TM2D1-211ENST00000496465 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.31■■□□□ 1.64
TM2D1-211ENST00000496465 PROM2Q8N271 834 aa25.31■■□□□ 1.64
TM2D1-211ENST00000496465 BTAF1O14981 1849 aa25.29■■□□□ 1.64
TM2D1-211ENST00000496465 KCNQ2O43526 872 aa25.29■■□□□ 1.64
TM2D1-211ENST00000496465 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.29■■□□□ 1.64
TM2D1-211ENST00000496465 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
TM2D1-211ENST00000496465 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.28■■□□□ 1.64
TM2D1-211ENST00000496465 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.26■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 INSRP06213 1382 aa25.26■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.25■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 FLT4P35916 1363 aa25.24■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 TXNRD1Q16881 649 aa25.24■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.24■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 NBPF4Q96M43 638 aa25.24■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 MEGF6O75095 1541 aa25.23■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.23■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 CASZ1Q86V15 1759 aa25.23■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.22■■□□□ 1.63
TM2D1-211ENST00000496465 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
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