RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.44■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 SLFN5Q08AF3 891 aa20.44■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 MYL6BP14649 208 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 NEK4P51957 841 aa20.43■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 NSD2O96028 1365 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 IFT57Q9NWB7 429 aa20.42■□□□□ 0.86
NISCH-213ENST00000489895 STARD3NLO95772 234 aa20.41■□□□□ 0.86
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NISCH-213ENST00000489895 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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NISCH-213ENST00000489895 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.38■□□□□ 0.85
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NISCH-213ENST00000489895 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NISCH-213ENST00000489895 SIL1Q9H173 461 aa20.37■□□□□ 0.85
NISCH-213ENST00000489895 PLCH2O75038 1416 aa20.37■□□□□ 0.85
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NISCH-213ENST00000489895 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
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NISCH-213ENST00000489895 SDF4Q9BRK5 362 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-213ENST00000489895 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.36■□□□□ 0.85
NISCH-213ENST00000489895 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NISCH-213ENST00000489895 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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NISCH-213ENST00000489895 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-213ENST00000489895 NFKBIBQ15653 356 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-213ENST00000489895 AACSQ86V21 672 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-213ENST00000489895 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.35■□□□□ 0.85
NISCH-213ENST00000489895 PIP4K2BP78356 416 aa20.34■□□□□ 0.85
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NISCH-213ENST00000489895 PDE4CQ08493 712 aa20.33■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.33■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.33■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 BACH2Q9BYV9 841 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 TNRQ92752 1358 aa20.32■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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NISCH-213ENST00000489895 JMYQ8N9B5 988 aa20.31■□□□□ 0.84
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NISCH-213ENST00000489895 ATP10BO94823 1461 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 RAB11FIP3O75154 756 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 MCM10Q7L590 875 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.31■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.31■□□□□ 0.84
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NISCH-213ENST00000489895 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 KRT32Q14532 448 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 FOXO3O43524 673 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 KINO60870 393 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 GPS2Q13227 327 aa20.3■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 MTMR7Q9Y216 660 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 HOMER1Q86YM7 354 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 AKAP2Q9Y2D5 859 aa20.29■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 ASXL2Q76L83 1435 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.28■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.27■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
NISCH-213ENST00000489895 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
NISCH-213ENST00000489895 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
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