RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483398.5

TP53BP2-209, Transcript of tumor protein p53 binding protein 2, human

TSL 2

Gene TP53BP2, Length 1,841 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TP53BP2-209	ENST00000483398	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	USP19	O94966	1318 aa		11.23	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	PXDN	Q92626	1479 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	NEFM	P07197	916 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	IP6K1	Q92551	441 aa		11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	NFAT5	O94916	1531 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	ALS2	Q96Q42	1657 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TP53BP2-209	ENST00000483398	SLFN5	Q08AF3	891 aa		11.21	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	SLIT3	O75094	1523 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	RTL1	A6NKG5	1358 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	RIPK4	P57078	832 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	ARHGEF10	O15013	1369 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	EYA1	Q99502	592 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	LTN1	O94822	1766 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398		E9PSI1	815 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	NFE2L2	Q16236	605 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	NEFL	P07196	543 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	KDR	P35968	1356 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	FKBP8	Q14318	412 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TP53BP2-209	ENST00000483398	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	NBPF4	Q96M43	638 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	TOM1	O60784	492 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	IL16	Q14005	1332 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	CPD	O75976	1380 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	KIAA0232	Q92628	1395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	CHRNA2	Q15822	529 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	ERBB3	P21860	1342 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	FAM83G	A6ND36	823 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	PIP4K2B	P78356	416 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	RGPD5	Q99666	1765 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	COL18A1	P39060	1754 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TP53BP2-209	ENST00000483398	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	MCM10	Q7L590	875 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	IFT57	Q9NWB7	429 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	ZNF853	P0CG23	659 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	GNAI1	P63096	354 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	ABCC6	O95255	1503 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TP53BP2-209	ENST00000483398	PLIN1	O60240	522 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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