RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478981.1

BNIP2-208, Transcript of BCL2 interacting protein 2, human

TSL 3

Gene BNIP2, Length 1,415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BNIP2-208	ENST00000478981	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	GPR37L1	O60883	481 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	NDUFV2	P19404	249 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		11.23	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	RCCD1	A6NED2	376 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	PRSS12	P56730	875 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	NCOA1	Q15788	1441 aa		11.22	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	ATP10A	O60312	1499 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	VAC14	Q08AM6	782 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	USP35	Q9P2H5	1018 aa		11.21	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
BNIP2-208	ENST00000478981	KIF15	Q9NS87	1388 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ADGRL2	O95490	1459 aa		11.21	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	UNCX	A6NJT0	531 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	SOX11	P35716	441 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	FOSB	P53539	338 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ROCK1	Q13464	1354 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	PLXNC1	O60486	1568 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		11.2	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	A2M	P01023	1474 aa		11.19	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	EYA1	Q99502	592 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	OTUD5	Q96G74	571 aa		11.18	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		11.17	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	RERE	Q9P2R6	1566 aa		11.16	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	11.16	□□□□□ -0.62	2e-6	■□□□□ 9.8
BNIP2-208	ENST00000478981	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	NAIP	Q13075	1403 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	KIF3B	O15066	747 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	NUDT7	P0C024	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ERCC3	P19447	782 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	MLEC	Q14165	292 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ARSI	Q5FYB1	569 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BNIP2-208	ENST00000478981	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	CDCA8	Q53HL2	280 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	AGL	P35573	1532 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	GGT6	Q6P531	493 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	KDM4A	O75164	1064 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	DNAJB2	P25686	324 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	USP46	P62068	366 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	GPR153	Q6NV75	609 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		11.11	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	SNPH	O15079	494 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	SEMA3F	Q13275	785 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	ATP9B	O43861	1147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	FDX1	P10109	184 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		11.09	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
BNIP2-208	ENST00000478981	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.08	□□□□□ -0.64
BNIP2-208	ENST00000478981	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		11.08	□□□□□ -0.64
BNIP2-208	ENST00000478981	HOXA2	O43364	376 aa		11.08	□□□□□ -0.64
BNIP2-208	ENST00000478981	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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