RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476675.5

PRKCE-208, Transcript of protein kinase C epsilon, human

TSL 4

Gene PRKCE, Length 570 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCE-208	ENST00000476675	CRB1	P82279	1406 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	SLC24A1	O60721	1099 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		28.17	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		28.16	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	CCDC125	Q86Z20	511 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	MYOM1	P52179	1685 aa		28.14	■■■□□ 2.1
PRKCE-208	ENST00000476675	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PRKCE-208	ENST00000476675	LTN1	O94822	1766 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PRKCE-208	ENST00000476675	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		28.12	■■■□□ 2.09
PRKCE-208	ENST00000476675	FBLN1	P23142	703 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PRKCE-208	ENST00000476675	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PRKCE-208	ENST00000476675	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
PRKCE-208	ENST00000476675	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
PRKCE-208	ENST00000476675	ABCC6	O95255	1503 aa		28.08	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		28.07	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	CDCA8	Q53HL2	280 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	LRRC37A3	O60309	1634 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	PDE3B	Q13370	1112 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	28.05	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	COG3	Q96JB2	828 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		28.04	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	FYB1	O15117	783 aa		28.03	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	28.03	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		28.02	■■■□□ 2.08
PRKCE-208	ENST00000476675	ERBB3	P21860	1342 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	TRIM37	O94972	964 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	DISP2	A7MBM2	1401 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		28	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		28	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	PEAK1	Q9H792	1746 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	BAG6	P46379	1132 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	DDB1	Q16531	1140 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	IP6K1	Q92551	441 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PRKCE-208	ENST00000476675	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	CCDC7	Q96M83	1385 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	HOXC9	P31274	260 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	AMPH	P49418	695 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	APBA3	O96018	575 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PRKCE-208	ENST00000476675	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PRKCE-208	ENST00000476675	TNS2	Q63HR2	1409 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PRKCE-208	ENST00000476675	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PRKCE-208	ENST00000476675	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PRKCE-208	ENST00000476675	SBF2	Q86WG5	1849 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PRKCE-208	ENST00000476675	EXOC5	O00471	708 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCE-208	ENST00000476675	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PRKCE-208	ENST00000476675	RTL1	A6NKG5	1358 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PRKCE-208	ENST00000476675	IL2RB	P14784	551 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PRKCE-208	ENST00000476675	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	PANK3	Q9H999	370 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	RREB1	Q92766	1687 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		27.78	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	NBPF4	Q96M43	638 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	BCL9	O00512	1426 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PRKCE-208	ENST00000476675	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	MEGF6	O75095	1541 aa		27.76	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	INSR	P06213	1382 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	FLT4	P35916	1363 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	KCNQ2	O43526	872 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		27.7	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.03
PRKCE-208	ENST00000476675	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PRKCE-208	ENST00000476675	NHS	Q6T4R5	1651 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PRKCE-208	ENST00000476675	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PRKCE-208	ENST00000476675	POLK	Q9UBT6	870 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PRKCE-208	ENST00000476675	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PRKCE-208	ENST00000476675	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PRKCE-208	ENST00000476675	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PRKCE-208	ENST00000476675	PROM2	Q8N271	834 aa		27.65	■■■□□ 2.02

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